99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1502 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1502  ceramide glucosyltransferase  100 
 
 
402 aa  807    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3035  Ceramide glucosyltransferase  71.51 
 
 
387 aa  504  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0451  ceramide glucosyltransferase  53.74 
 
 
424 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7359  ceramide glucosyltransferase  32.51 
 
 
380 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0687  Ceramide glucosyltransferase  32.12 
 
 
390 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6606  ceramide glucosyltransferase  31.37 
 
 
402 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0714  ceramide glucosyltransferase  31.71 
 
 
394 aa  160  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.20894 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0727  Ceramide glucosyltransferase  31.4 
 
 
394 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3673  ceramide glucosyltransferase  31.19 
 
 
368 aa  155  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.081792 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0130  Ceramide glucosyltransferase  30.84 
 
 
381 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0822  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.12 
 
 
362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0826  putative ceramide glucosyltransferase  32.35 
 
 
362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492531  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2152  ceramide glucosyltransferase  32.35 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3865  ceramide glucosyltransferase  29.45 
 
 
382 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3633  glycosyltransferase  30.15 
 
 
392 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0384  putative glycosyltransferase  28.62 
 
 
401 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2068  glycosyl transferase family protein  25.13 
 
 
424 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  25.4 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.569383  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02280  conserved hypothetical protein  25.45 
 
 
450 aa  97.4  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.380416  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  27.27 
 
 
406 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4282  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
391 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0697  ceramide glucosyltransferase, putative  25.09 
 
 
399 aa  92.8  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1031  ceramide glucosyltransferase  24.47 
 
 
404 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1749  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.81 
 
 
392 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2738  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.81 
 
 
392 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2797  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.81 
 
 
392 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2853  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.81 
 
 
392 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0578  syl transferase, group 2 family protein  28.81 
 
 
392 aa  89.7  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1780  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  26.2 
 
 
386 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1170  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
391 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2195  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  25.95 
 
 
435 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2860  syl transferase, group 2 family protein  28.81 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2121  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.2 
 
 
386 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.557939  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0691  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 
391 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1146  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  29.17 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.699851 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1291  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  26.12 
 
 
392 aa  87  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522898  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2134  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  28.29 
 
 
392 aa  87  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.771649 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20650  Glycosyl transferase, family 2  24.56 
 
 
386 aa  86.7  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0563  ceramide glucosyltransferase, putative  24.93 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0275595  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1052  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  26.98 
 
 
391 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2815  ceramide glucosyltransferase, putative  23.29 
 
 
391 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0888  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  26.6 
 
 
386 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0492799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0723  ceramide glucosyltransferase, putative  22.84 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1049  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
391 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0746  glycosyl transferase family 2  21.82 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0775  glycosyl transferase family 2  21.82 
 
 
384 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117577  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3568  glycosyl transferase family 2  22.25 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3357  ceramide glucosyltransferase, putative  25.58 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178886  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1602  glycosyl transferase family 2  23.93 
 
 
382 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7079  putative (ceramide) glucosyltransferase  24.24 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.806825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1766  syl transferase, group 2 family protein  28.39 
 
 
560 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.365362  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0943  glycosyltransferase  29.49 
 
 
405 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343577  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2063  putative (ceramide) glucosyltransferase  22.92 
 
 
386 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.163903 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4900  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287952  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0896  glycosyltransferase  27.51 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0654391  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1835  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  24.17 
 
 
397 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3407  glycosyl transferase family protein  23.77 
 
 
380 aa  70.9  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2200  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  23.88 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0294  putative glycosyltransferase  25.32 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4954  glycosyl transferase family protein  21.61 
 
 
391 aa  69.7  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00767556  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0488  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.32 
 
 
415 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2073  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.89 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3019  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.89 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3350  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.89 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3328  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.89 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.47 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0308  putative glycosyltransferase  26.47 
 
 
422 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0974  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  24.26 
 
 
402 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3123  glycosyl transferase family protein  21.9 
 
 
415 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00523086  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5069  glycosyl transferase family 2  20.9 
 
 
391 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0724  ceramide glucosyltransferase, putative  19.82 
 
 
417 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0471  Acyl-CoA dehydrogenase-like  21.89 
 
 
389 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956035  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  25.76 
 
 
421 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3653  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  23.83 
 
 
398 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  25.83 
 
 
1099 aa  54.3  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5080  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  21.89 
 
 
389 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53942  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3454  putative glucosyltransferase  22.55 
 
 
398 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  0.104768 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3763  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  22.55 
 
 
398 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  24.89 
 
 
421 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  27.45 
 
 
514 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  24.89 
 
 
421 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  23.79 
 
 
752 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7153  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  22.93 
 
 
395 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
322 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34303  ceramide glucosyltransferase  20.17 
 
 
520 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  23.55 
 
 
461 aa  47.4  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  24.58 
 
 
402 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
334 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0400  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  23.04 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.443716  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
391 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 
495 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3312  bacteriophage N4 adsorption protein B  24.17 
 
 
442 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6338  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  22.1 
 
 
395 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0080021 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1481  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
412 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.935804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
1231 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  20.86 
 
 
863 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0464  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
631 aa  43.1  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219414  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  20.86 
 
 
863 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.27 
 
 
980 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0324719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>