159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6338 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7153  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  88.61 
 
 
395 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6338  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  100 
 
 
395 aa  795    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0080021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3454  putative glucosyltransferase  70.59 
 
 
398 aa  546  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  0.104768 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3763  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  70.84 
 
 
398 aa  544  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3653  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  69.72 
 
 
398 aa  520  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0974  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  68.72 
 
 
402 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2063  putative (ceramide) glucosyltransferase  44.06 
 
 
386 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.163903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2200  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  44.99 
 
 
386 aa  293  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3350  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.02 
 
 
417 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3019  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.02 
 
 
417 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2073  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.02 
 
 
417 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0294  putative glycosyltransferase  44.02 
 
 
415 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3328  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.02 
 
 
417 aa  278  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0488  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.02 
 
 
415 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0308  putative glycosyltransferase  43.48 
 
 
422 aa  276  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7079  putative (ceramide) glucosyltransferase  43.13 
 
 
404 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.806825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.21 
 
 
415 aa  269  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20650  Glycosyl transferase, family 2  43.16 
 
 
386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5080  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  44.54 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53942  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0471  Acyl-CoA dehydrogenase-like  42.12 
 
 
389 aa  229  9e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956035  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0578  syl transferase, group 2 family protein  43.65 
 
 
392 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2853  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.65 
 
 
392 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2738  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.65 
 
 
392 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2797  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.65 
 
 
392 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1749  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.65 
 
 
392 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2860  syl transferase, group 2 family protein  43.51 
 
 
393 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4900  glycosyl transferase family protein  40.88 
 
 
368 aa  223  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287952  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3407  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
380 aa  221  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0697  ceramide glucosyltransferase, putative  35.36 
 
 
399 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2068  glycosyl transferase family protein  39.74 
 
 
424 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0384  putative glycosyltransferase  40 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  35.64 
 
 
406 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2815  ceramide glucosyltransferase, putative  33.15 
 
 
391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1291  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  39.89 
 
 
392 aa  212  7.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522898  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4282  glycosyl transferase family protein  42.81 
 
 
391 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1146  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  42.81 
 
 
391 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.699851 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0691  glycosyl transferase family protein  42.81 
 
 
391 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1170  glycosyl transferase family protein  42.81 
 
 
391 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1031  ceramide glucosyltransferase  35.08 
 
 
404 aa  210  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1049  glycosyl transferase family protein  43.17 
 
 
391 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1052  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  42.81 
 
 
391 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1766  syl transferase, group 2 family protein  44.33 
 
 
560 aa  207  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.365362  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2134  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  43.23 
 
 
392 aa  206  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.771649 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2195  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  38.99 
 
 
435 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0563  ceramide glucosyltransferase, putative  34.9 
 
 
380 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0275595  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1835  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.1 
 
 
397 aa  193  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  34.32 
 
 
378 aa  192  9e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.569383  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3123  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
415 aa  187  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00523086  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0723  ceramide glucosyltransferase, putative  33.68 
 
 
385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4954  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 
391 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00767556  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0724  ceramide glucosyltransferase, putative  29.46 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2121  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.37 
 
 
386 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.557939  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1780  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  37.37 
 
 
386 aa  172  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0746  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
384 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0775  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
384 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117577  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0888  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  35.14 
 
 
386 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0492799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3357  ceramide glucosyltransferase, putative  32.78 
 
 
386 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178886  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3568  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1602  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
382 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5069  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3633  glycosyltransferase  31.1 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0943  glycosyltransferase  32.3 
 
 
405 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343577  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0896  glycosyltransferase  35.92 
 
 
405 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0654391  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0714  ceramide glucosyltransferase  28.37 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.20894 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0727  Ceramide glucosyltransferase  28.37 
 
 
394 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0826  putative ceramide glucosyltransferase  29.68 
 
 
362 aa  96.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492531  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0687  Ceramide glucosyltransferase  27.64 
 
 
390 aa  94  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2152  ceramide glucosyltransferase  29.39 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0822  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.24 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3673  ceramide glucosyltransferase  27.51 
 
 
368 aa  89.7  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.081792 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0130  Ceramide glucosyltransferase  27.89 
 
 
381 aa  86.7  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6606  ceramide glucosyltransferase  29.43 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7359  ceramide glucosyltransferase  28 
 
 
380 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3865  ceramide glucosyltransferase  28.96 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02280  conserved hypothetical protein  34.48 
 
 
450 aa  70.9  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.380416  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
365 aa  63.2  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  27.71 
 
 
752 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  24.5 
 
 
352 aa  60.8  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0400  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  23.42 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.443716  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2583  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8679  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3035  Ceramide glucosyltransferase  25.3 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.43 
 
 
402 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0451  ceramide glucosyltransferase  23.64 
 
 
424 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
495 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
637 aa  56.2  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  23.34 
 
 
343 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0447  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0126629  normal  0.0526051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  22.36 
 
 
324 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.525807 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08806  ceramide glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09550)  28.14 
 
 
618 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2255  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.41 
 
 
391 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.212112  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  24.07 
 
 
343 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
428 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  26.41 
 
 
381 aa  53.9  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1481  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
412 aa  53.5  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.935804  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1498  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
354 aa  53.5  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2356  glycosyl transferase family protein  20.7 
 
 
380 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  23.93 
 
 
469 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  22.82 
 
 
343 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 
420 aa  52.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  30.24 
 
 
479 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>