120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2068 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2068  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
424 aa  850    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2195  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  83.22 
 
 
435 aa  699    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0384  putative glycosyltransferase  71.46 
 
 
401 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  59.28 
 
 
406 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2860  syl transferase, group 2 family protein  62.2 
 
 
393 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0578  syl transferase, group 2 family protein  61.72 
 
 
392 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4282  glycosyl transferase family protein  66.18 
 
 
391 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2853  glycosyl transferase, group 2 family protein  61.72 
 
 
392 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2738  glycosyl transferase, group 2 family protein  61.72 
 
 
392 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2797  glycosyl transferase, group 2 family protein  61.72 
 
 
392 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1749  glycosyl transferase, group 2 family protein  61.72 
 
 
392 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1052  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  65.33 
 
 
391 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0691  glycosyl transferase family protein  65.03 
 
 
391 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1049  glycosyl transferase family protein  64.47 
 
 
391 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1170  glycosyl transferase family protein  65.03 
 
 
391 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1146  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  65.32 
 
 
391 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.699851 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2134  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  63.32 
 
 
392 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.771649 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1766  syl transferase, group 2 family protein  61.74 
 
 
560 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.365362  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4900  glycosyl transferase family protein  57.49 
 
 
368 aa  335  9e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287952  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3407  glycosyl transferase family protein  52.49 
 
 
380 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20650  Glycosyl transferase, family 2  53.01 
 
 
386 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3763  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  40.05 
 
 
398 aa  226  6e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3454  putative glucosyltransferase  39.53 
 
 
398 aa  225  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  0.104768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0974  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  42.95 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0697  ceramide glucosyltransferase, putative  38.75 
 
 
399 aa  216  9e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3653  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  42.61 
 
 
398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1780  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  49.79 
 
 
386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2121  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.79 
 
 
386 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.557939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1031  ceramide glucosyltransferase  38.69 
 
 
404 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7153  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  41.81 
 
 
395 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2200  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  38.7 
 
 
386 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7079  putative (ceramide) glucosyltransferase  41.35 
 
 
404 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.806825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6338  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  40.94 
 
 
395 aa  206  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0080021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2063  putative (ceramide) glucosyltransferase  38.14 
 
 
386 aa  206  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.163903 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2815  ceramide glucosyltransferase, putative  37.32 
 
 
391 aa  202  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0563  ceramide glucosyltransferase, putative  38.2 
 
 
380 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0275595  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1291  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  46.4 
 
 
392 aa  200  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522898  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1835  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  44.11 
 
 
397 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3123  glycosyl transferase family protein  38.25 
 
 
415 aa  196  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00523086  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3350  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.17 
 
 
417 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0488  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.17 
 
 
415 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3019  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.17 
 
 
417 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2073  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.17 
 
 
417 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3328  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.17 
 
 
417 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0294  putative glycosyltransferase  37.17 
 
 
415 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0888  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  40.66 
 
 
386 aa  192  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0492799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.21 
 
 
415 aa  192  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0308  putative glycosyltransferase  36.87 
 
 
422 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  37.17 
 
 
378 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.569383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3357  ceramide glucosyltransferase, putative  40.61 
 
 
386 aa  190  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178886  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0471  Acyl-CoA dehydrogenase-like  38.59 
 
 
389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956035  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0723  ceramide glucosyltransferase, putative  36.23 
 
 
385 aa  183  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5080  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  36.18 
 
 
389 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53942  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1602  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 
382 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3568  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
374 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72447 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0775  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
384 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117577  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0746  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
384 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4954  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
391 aa  151  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00767556  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5069  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 
391 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0724  ceramide glucosyltransferase, putative  31.79 
 
 
417 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3633  glycosyltransferase  32.36 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0943  glycosyltransferase  32.69 
 
 
405 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343577  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0896  glycosyltransferase  32.14 
 
 
405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0654391  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7359  ceramide glucosyltransferase  32.43 
 
 
380 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0130  Ceramide glucosyltransferase  27.73 
 
 
381 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6606  ceramide glucosyltransferase  29.46 
 
 
402 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3035  Ceramide glucosyltransferase  28.46 
 
 
387 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0714  ceramide glucosyltransferase  28.24 
 
 
394 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.20894 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3673  ceramide glucosyltransferase  26.53 
 
 
368 aa  100  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.081792 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0727  Ceramide glucosyltransferase  28.11 
 
 
394 aa  100  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0687  Ceramide glucosyltransferase  27.89 
 
 
390 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1502  ceramide glucosyltransferase  27.35 
 
 
402 aa  90.1  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0451  ceramide glucosyltransferase  25.21 
 
 
424 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3865  ceramide glucosyltransferase  31.02 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2152  ceramide glucosyltransferase  28.9 
 
 
362 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0822  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.33 
 
 
362 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0826  putative ceramide glucosyltransferase  28.14 
 
 
362 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492531  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02280  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
450 aa  72  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.380416  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2582  hypothetical protein  24.82 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0706725  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3924  family 2 glycosyl transferase  24.24 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.2 
 
 
402 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34303  ceramide glucosyltransferase  26.99 
 
 
520 aa  60.8  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0400  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  24.59 
 
 
388 aa  60.1  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.443716  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2583  glycosyl transferase family protein  23.51 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8679  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  24 
 
 
1231 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0623  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
354 aa  57  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000260018  hitchhiker  0.000000106889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  22.71 
 
 
980 aa  56.6  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28550  glycosyl transferase  31.82 
 
 
449 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00136572  normal  0.0940176 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
365 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08806  ceramide glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09550)  27.11 
 
 
618 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  22.56 
 
 
362 aa  52.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  25 
 
 
1101 aa  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  27.75 
 
 
716 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  19.3 
 
 
379 aa  49.3  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2252  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 
414 aa  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2255  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  24.51 
 
 
391 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.212112  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
772 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  25.64 
 
 
352 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  28.47 
 
 
1099 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3257  cellulose synthase (UDP-forming)  26.54 
 
 
624 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.660262  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>