113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1049 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4282  glycosyl transferase family protein  92.07 
 
 		 391 aa  701    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0691  glycosyl transferase family protein  92.33 
 
 		 391 aa  673    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1049  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 391 aa  769    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1170  glycosyl transferase family protein  92.33 
 
 		 391 aa  673    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1146  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  92.58 
 
 		 391 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699851 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1052  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  97.7 
 
 		 391 aa  731    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2134  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  87.95 
 
 		 392 aa  597  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.771649 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0578  syl transferase, group 2 family protein  79.34 
 
 		 392 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2853  glycosyl transferase, group 2 family protein  79.34 
 
 		 392 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2738  glycosyl transferase, group 2 family protein  79.34 
 
 		 392 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2797  glycosyl transferase, group 2 family protein  79.34 
 
 		 392 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1749  glycosyl transferase, group 2 family protein  79.34 
 
 		 392 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2860  syl transferase, group 2 family protein  79.13 
 
 		 393 aa  577  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1766  syl transferase, group 2 family protein  79.59 
 
 		 560 aa  554  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.365362  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0384  putative glycosyltransferase  62.56 
 
 		 401 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2068  glycosyl transferase family protein  59.71 
 
 		 424 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2195  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  56.19 
 
 		 435 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  55.67 
 
 		 406 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3407  glycosyl transferase family protein  52.37 
 
 		 380 aa  342  8e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4900  glycosyl transferase family protein  54.4 
 
 		 368 aa  332  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287952  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20650  Glycosyl transferase, family 2  48.92 
 
 		 386 aa  322  5e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3763  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  39.23 
 
 		 398 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3454  putative glucosyltransferase  38.72 
 
 		 398 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  0.104768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3653  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  38 
 
 		 398 aa  208  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0974  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  42.96 
 
 		 402 aa  206  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7153  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  44.66 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1780  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  38.55 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2121  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.55 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.557939  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6338  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  42.81 
 
 		 395 aa  203  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0080021 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0563  ceramide glucosyltransferase, putative  36.66 
 
 		 380 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0275595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1031  ceramide glucosyltransferase  36.01 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2815  ceramide glucosyltransferase, putative  36.01 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2063  putative (ceramide) glucosyltransferase  36.52 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.163903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3123  glycosyl transferase family protein  38.17 
 
 		 415 aa  192  9e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00523086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1291  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  38.21 
 
 		 392 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0697  ceramide glucosyltransferase, putative  36.93 
 
 		 399 aa  190  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3357  ceramide glucosyltransferase, putative  40.55 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0888  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  40.91 
 
 		 386 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0492799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0723  ceramide glucosyltransferase, putative  34.37 
 
 		 385 aa  186  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2200  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  35.01 
 
 		 386 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7079  putative (ceramide) glucosyltransferase  36.99 
 
 		 404 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.806825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  36.34 
 
 		 378 aa  176  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.569383  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.67 
 
 		 415 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3568  glycosyl transferase family 2  32.6 
 
 		 374 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72447 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0488  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.06 
 
 		 415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3350  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.06 
 
 		 417 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3019  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.06 
 
 		 417 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2073  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.06 
 
 		 417 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3328  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.06 
 
 		 417 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0294  putative glycosyltransferase  38.06 
 
 		 415 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5080  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  35.15 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0308  putative glycosyltransferase  37.69 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1602  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0471  Acyl-CoA dehydrogenase-like  36.97 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0724  ceramide glucosyltransferase, putative  32.46 
 
 		 417 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1835  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  39.23 
 
 		 397 aa  157  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4954  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00767556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0775  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 		 384 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0746  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 		 384 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0714  ceramide glucosyltransferase  30.97 
 
 		 394 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.20894 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0727  Ceramide glucosyltransferase  30.97 
 
 		 394 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5069  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0687  Ceramide glucosyltransferase  31.36 
 
 		 390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6606  ceramide glucosyltransferase  30.97 
 
 		 402 aa  123  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3673  ceramide glucosyltransferase  29.89 
 
 		 368 aa  119  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.081792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7359  ceramide glucosyltransferase  31.36 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0130  Ceramide glucosyltransferase  26.36 
 
 		 381 aa  106  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3633  glycosyltransferase  29.34 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0943  glycosyltransferase  30.73 
 
 		 405 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343577  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0822  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.86 
 
 		 362 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3865  ceramide glucosyltransferase  29.94 
 
 		 382 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2152  ceramide glucosyltransferase  29.08 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0826  putative ceramide glucosyltransferase  28.83 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0896  glycosyltransferase  30.45 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0654391  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02280  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 		 450 aa  81.6  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.380416  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1502  ceramide glucosyltransferase  27.12 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3035  Ceramide glucosyltransferase  24.58 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0451  ceramide glucosyltransferase  24.56 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  0.123982 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08806  ceramide glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09550)  29.82 
 
 		 618 aa  67  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34303  ceramide glucosyltransferase  24.69 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1246  glycosyl transferase family protein  22.82 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0864395  hitchhiker  0.00406978 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3924  family 2 glycosyl transferase  21.9 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2583  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.1 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2582  hypothetical protein  22.39 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0706725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1462  putative glycosyltransferase  26.8 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046931  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  26.52 
 
 		 473 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0447  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0126629  normal  0.0526051 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  21.64 
 
 		 384 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1688  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000485496 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1394  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  25.53 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00767867  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  27.81 
 
 		 365 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  22.11 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  24.25 
 
 		 362 aa  49.7  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  28.32 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 		 494 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 		 291 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2356  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 		 380 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0623  glycosyl transferase family protein  23.88 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000260018  hitchhiker  0.000000106889 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  22.97 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>