146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1780 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2121  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
386 aa  774    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.557939  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1780  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  100 
 
 
386 aa  774    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3407  glycosyl transferase family protein  46.27 
 
 
380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2068  glycosyl transferase family protein  41.6 
 
 
424 aa  232  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  47.41 
 
 
406 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20650  Glycosyl transferase, family 2  40 
 
 
386 aa  226  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2195  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  41.94 
 
 
435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1049  glycosyl transferase family protein  38.55 
 
 
391 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0384  putative glycosyltransferase  39.82 
 
 
401 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1052  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  38.83 
 
 
391 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4282  glycosyl transferase family protein  38.37 
 
 
391 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0691  glycosyl transferase family protein  38.08 
 
 
391 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1170  glycosyl transferase family protein  38.08 
 
 
391 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0578  syl transferase, group 2 family protein  39.17 
 
 
392 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4900  glycosyl transferase family protein  46.22 
 
 
368 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287952  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2860  syl transferase, group 2 family protein  39.17 
 
 
393 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2853  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.17 
 
 
392 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2738  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.17 
 
 
392 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2797  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.17 
 
 
392 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1749  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.17 
 
 
392 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2134  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  45.71 
 
 
392 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.771649 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0723  ceramide glucosyltransferase, putative  35.92 
 
 
385 aa  200  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1146  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  37.32 
 
 
391 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.699851 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1291  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  46 
 
 
392 aa  199  7e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522898  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1766  syl transferase, group 2 family protein  44.4 
 
 
560 aa  193  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.365362  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2200  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  35.03 
 
 
386 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0775  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
384 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117577  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0746  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
384 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1031  ceramide glucosyltransferase  33.73 
 
 
404 aa  189  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3123  glycosyl transferase family protein  35.73 
 
 
415 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00523086  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7079  putative (ceramide) glucosyltransferase  37.01 
 
 
404 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.806825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2063  putative (ceramide) glucosyltransferase  34.73 
 
 
386 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.163903 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.98 
 
 
415 aa  186  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1835  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.1 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3357  ceramide glucosyltransferase, putative  34.52 
 
 
386 aa  182  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178886  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2815  ceramide glucosyltransferase, putative  36.2 
 
 
391 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0471  Acyl-CoA dehydrogenase-like  40.32 
 
 
389 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956035  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0488  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.94 
 
 
415 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4954  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 
391 aa  179  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00767556  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3350  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.98 
 
 
417 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3019  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.98 
 
 
417 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2073  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.98 
 
 
417 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0294  putative glycosyltransferase  36.94 
 
 
415 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3328  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.98 
 
 
417 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0308  putative glycosyltransferase  36.69 
 
 
422 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5080  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  35.61 
 
 
389 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53942  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0974  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  34.43 
 
 
402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0888  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  33.33 
 
 
386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0492799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6338  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  35.21 
 
 
395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0080021 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3454  putative glucosyltransferase  34 
 
 
398 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  0.104768 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3763  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  33.84 
 
 
398 aa  169  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7153  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  34.99 
 
 
395 aa  169  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0563  ceramide glucosyltransferase, putative  32.25 
 
 
380 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0275595  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3653  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  37.3 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0697  ceramide glucosyltransferase, putative  33.14 
 
 
399 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3568  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
374 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5069  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
391 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0724  ceramide glucosyltransferase, putative  28.8 
 
 
417 aa  149  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  32.35 
 
 
378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.569383  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1602  glycosyl transferase family 2  33.92 
 
 
382 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0943  glycosyltransferase  32.28 
 
 
405 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343577  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0896  glycosyltransferase  31.32 
 
 
405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0654391  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3633  glycosyltransferase  30.37 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3673  ceramide glucosyltransferase  28.46 
 
 
368 aa  99.4  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.081792 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0451  ceramide glucosyltransferase  29.58 
 
 
424 aa  99  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0826  putative ceramide glucosyltransferase  31.12 
 
 
362 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492531  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2152  ceramide glucosyltransferase  30.82 
 
 
362 aa  96.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3035  Ceramide glucosyltransferase  28.1 
 
 
387 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0714  ceramide glucosyltransferase  28.45 
 
 
394 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.20894 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0687  Ceramide glucosyltransferase  28.03 
 
 
390 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0727  Ceramide glucosyltransferase  28.03 
 
 
394 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0822  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.14 
 
 
362 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3865  ceramide glucosyltransferase  31.12 
 
 
382 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0130  Ceramide glucosyltransferase  25.07 
 
 
381 aa  89  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7359  ceramide glucosyltransferase  28.44 
 
 
380 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1502  ceramide glucosyltransferase  26.4 
 
 
402 aa  88.6  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6606  ceramide glucosyltransferase  27.54 
 
 
402 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02280  conserved hypothetical protein  35.34 
 
 
450 aa  86.3  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.380416  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  22.1 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  22.94 
 
 
461 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34303  ceramide glucosyltransferase  27.2 
 
 
520 aa  62.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
384 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1835  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
395 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0447  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
385 aa  57  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0126629  normal  0.0526051 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1394  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  23.96 
 
 
392 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00767867  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3924  family 2 glycosyl transferase  20.73 
 
 
419 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0400  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  23.6 
 
 
388 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.443716  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08806  ceramide glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09550)  26.12 
 
 
618 aa  53.5  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2582  hypothetical protein  23.92 
 
 
409 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0706725  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  24.27 
 
 
422 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1196  b-glycosyltransferase  26.99 
 
 
349 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.959593  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  25.85 
 
 
343 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1994  glycosyl transferase family 2  24.07 
 
 
383 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 
476 aa  50.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  22.96 
 
 
343 aa  50.4  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  25.1 
 
 
749 aa  50.1  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4598  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  26.69 
 
 
400 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.617719  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1462  putative glycosyltransferase  26.95 
 
 
401 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046931  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  22.69 
 
 
475 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 
509 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>