143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0130 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0130  Ceramide glucosyltransferase  100 
 
 
381 aa  778    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3673  ceramide glucosyltransferase  61.74 
 
 
368 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.081792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7359  ceramide glucosyltransferase  57.26 
 
 
380 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0714  ceramide glucosyltransferase  55.22 
 
 
394 aa  401  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.20894 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0727  Ceramide glucosyltransferase  54.95 
 
 
394 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0687  Ceramide glucosyltransferase  55.19 
 
 
390 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6606  ceramide glucosyltransferase  58.56 
 
 
402 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3865  ceramide glucosyltransferase  54.97 
 
 
382 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0822  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  47.37 
 
 
362 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0826  putative ceramide glucosyltransferase  47.94 
 
 
362 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492531  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2152  ceramide glucosyltransferase  47.94 
 
 
362 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0451  ceramide glucosyltransferase  30.59 
 
 
424 aa  162  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3035  Ceramide glucosyltransferase  31.86 
 
 
387 aa  159  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1502  ceramide glucosyltransferase  30.24 
 
 
402 aa  152  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3407  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 
380 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  29.52 
 
 
406 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1031  ceramide glucosyltransferase  28.2 
 
 
404 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2068  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
424 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0888  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  31.01 
 
 
386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0492799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3357  ceramide glucosyltransferase, putative  30.85 
 
 
386 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178886  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0578  syl transferase, group 2 family protein  28.32 
 
 
392 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2853  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.32 
 
 
392 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2738  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.32 
 
 
392 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2797  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.32 
 
 
392 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1749  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.32 
 
 
392 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2860  syl transferase, group 2 family protein  28.32 
 
 
393 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0384  putative glycosyltransferase  27.68 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1049  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1052  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  27.3 
 
 
391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1291  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  30.74 
 
 
392 aa  113  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522898  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20650  Glycosyl transferase, family 2  29.37 
 
 
386 aa  113  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2815  ceramide glucosyltransferase, putative  29.07 
 
 
391 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2134  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  26.96 
 
 
392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.771649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0691  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 
391 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1170  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 
391 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4282  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
391 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3568  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
374 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72447 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0697  ceramide glucosyltransferase, putative  27.99 
 
 
399 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1146  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  26.28 
 
 
391 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.699851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3653  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  29.01 
 
 
398 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1835  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.14 
 
 
397 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2195  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  26.82 
 
 
435 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0974  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  27.97 
 
 
402 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3763  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  28.9 
 
 
398 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3454  putative glucosyltransferase  28.9 
 
 
398 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  0.104768 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02280  conserved hypothetical protein  25.15 
 
 
450 aa  100  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.380416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4900  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 
368 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287952  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3633  glycosyltransferase  28.61 
 
 
392 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  29.64 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.569383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0943  glycosyltransferase  32.26 
 
 
405 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343577  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1780  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  28.22 
 
 
386 aa  96.3  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2121  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.22 
 
 
386 aa  96.3  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.557939  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1766  syl transferase, group 2 family protein  28.01 
 
 
560 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.365362  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0563  ceramide glucosyltransferase, putative  28.02 
 
 
380 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0275595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0723  ceramide glucosyltransferase, putative  26.57 
 
 
385 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0896  glycosyltransferase  30.8 
 
 
405 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0654391  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1602  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
382 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0746  glycosyl transferase family 2  21.74 
 
 
384 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0775  glycosyl transferase family 2  21.74 
 
 
384 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117577  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3123  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 
415 aa  89.7  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00523086  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6338  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  28.24 
 
 
395 aa  87  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0080021 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7079  putative (ceramide) glucosyltransferase  25.61 
 
 
404 aa  87  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.806825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0724  ceramide glucosyltransferase, putative  24.12 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7153  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  25.59 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4954  glycosyl transferase family protein  21.74 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00767556  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0294  putative glycosyltransferase  28.12 
 
 
415 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3350  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.12 
 
 
417 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0488  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.12 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2063  putative (ceramide) glucosyltransferase  27.06 
 
 
386 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.163903 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3019  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.12 
 
 
417 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2073  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.12 
 
 
417 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3328  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.12 
 
 
417 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2200  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  27.06 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34303  ceramide glucosyltransferase  32.26 
 
 
520 aa  80.1  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0308  putative glycosyltransferase  27.73 
 
 
422 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5069  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 
391 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5080  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  24.54 
 
 
389 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53942  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0471  Acyl-CoA dehydrogenase-like  23.53 
 
 
389 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956035  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.69 
 
 
415 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08806  ceramide glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09550)  31.69 
 
 
618 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
428 aa  55.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  24.42 
 
 
461 aa  54.7  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0028  glycosyl transferase family 2  24.64 
 
 
352 aa  53.9  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  23.55 
 
 
422 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0790  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
342 aa  53.9  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.68906  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1246  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 
388 aa  53.5  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0864395  hitchhiker  0.00406978 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  20.92 
 
 
402 aa  53.1  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0310  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.38 
 
 
643 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0305  hypothetical protein  21.38 
 
 
423 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
365 aa  49.7  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0325  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.14 
 
 
643 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347044  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  28.88 
 
 
479 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5309  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286135  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4875  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596859  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5551  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  28.88 
 
 
479 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  22.34 
 
 
1129 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4721  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  27.04 
 
 
395 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5422  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  27.04 
 
 
395 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1196  b-glycosyltransferase  22.01 
 
 
349 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.959593  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>