110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3454 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3454  putative glucosyltransferase  100 
 
 		 398 aa  802    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  0.104768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3653  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  93.72 
 
 		 398 aa  700    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3763  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  98.74 
 
 		 398 aa  795    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7153  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  72.31 
 
 		 395 aa  528  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6338  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  70.33 
 
 		 395 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0080021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0974  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  67.42 
 
 		 402 aa  518  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2063  putative (ceramide) glucosyltransferase  46.72 
 
 		 386 aa  316  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.163903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2200  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  45.9 
 
 		 386 aa  305  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7079  putative (ceramide) glucosyltransferase  45.9 
 
 		 404 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.806825 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3350  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.14 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0488  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.14 
 
 		 415 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3019  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.14 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2073  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.14 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0294  putative glycosyltransferase  45.14 
 
 		 415 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3328  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.14 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0308  putative glycosyltransferase  44.86 
 
 		 422 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.14 
 
 		 415 aa  279  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5080  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  45.53 
 
 		 389 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20650  Glycosyl transferase, family 2  45.82 
 
 		 386 aa  256  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0471  Acyl-CoA dehydrogenase-like  44.89 
 
 		 389 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2068  glycosyl transferase family protein  41.09 
 
 		 424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2815  ceramide glucosyltransferase, putative  37.61 
 
 		 391 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0697  ceramide glucosyltransferase, putative  36.26 
 
 		 399 aa  232  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3407  glycosyl transferase family protein  42.24 
 
 		 380 aa  229  7e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4900  glycosyl transferase family protein  41.18 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287952  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  37.17 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0578  syl transferase, group 2 family protein  39.29 
 
 		 392 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4282  glycosyl transferase family protein  39.44 
 
 		 391 aa  225  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2853  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.29 
 
 		 392 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2738  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.29 
 
 		 392 aa  225  9e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2797  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.29 
 
 		 392 aa  225  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1749  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.29 
 
 		 392 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1291  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  40 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2860  syl transferase, group 2 family protein  39.59 
 
 		 393 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0384  putative glycosyltransferase  38.94 
 
 		 401 aa  222  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1049  glycosyl transferase family protein  39.13 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1052  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  38.8 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1031  ceramide glucosyltransferase  35.23 
 
 		 404 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0691  glycosyl transferase family protein  39.44 
 
 		 391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1170  glycosyl transferase family protein  39.44 
 
 		 391 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1146  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  43.12 
 
 		 391 aa  216  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699851 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0563  ceramide glucosyltransferase, putative  35.31 
 
 		 380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0275595  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2195  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  37.82 
 
 		 435 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2134  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  42.37 
 
 		 392 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.771649 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1766  syl transferase, group 2 family protein  42.61 
 
 		 560 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.365362  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1835  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.61 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  32.79 
 
 		 378 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.569383  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3123  glycosyl transferase family protein  36.2 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00523086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0723  ceramide glucosyltransferase, putative  33.59 
 
 		 385 aa  189  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0775  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0746  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0724  ceramide glucosyltransferase, putative  29.34 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4954  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 		 391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00767556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0888  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  33.52 
 
 		 386 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0492799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3357  ceramide glucosyltransferase, putative  35.63 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178886  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1780  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  36.95 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2121  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.95 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.557939  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3568  glycosyl transferase family 2  31.41 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1602  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 		 382 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5069  glycosyl transferase family 2  32.15 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0714  ceramide glucosyltransferase  28.16 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.20894 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0727  Ceramide glucosyltransferase  28.16 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0687  Ceramide glucosyltransferase  28.35 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0130  Ceramide glucosyltransferase  26.49 
 
 		 381 aa  99.8  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0943  glycosyltransferase  29.91 
 
 		 405 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3633  glycosyltransferase  27.75 
 
 		 392 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3673  ceramide glucosyltransferase  30.15 
 
 		 368 aa  95.1  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.081792 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0896  glycosyltransferase  30.04 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0654391  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6606  ceramide glucosyltransferase  29.72 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7359  ceramide glucosyltransferase  27.63 
 
 		 380 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0826  putative ceramide glucosyltransferase  27.11 
 
 		 362 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2152  ceramide glucosyltransferase  27.57 
 
 		 362 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0822  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  24.62 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02280  conserved hypothetical protein  34.82 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.380416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3865  ceramide glucosyltransferase  29.32 
 
 		 382 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0447  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0126629  normal  0.0526051 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3035  Ceramide glucosyltransferase  23.14 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34303  ceramide glucosyltransferase  27.16 
 
 		 520 aa  56.2  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0400  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  24.14 
 
 		 388 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.443716  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0451  ceramide glucosyltransferase  21.63 
 
 		 424 aa  53.9  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1246  glycosyl transferase family protein  23.7 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0864395  hitchhiker  0.00406978 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1502  ceramide glucosyltransferase  22.41 
 
 		 402 aa  53.9  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 		 365 aa  53.1  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08806  ceramide glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09550)  26.23 
 
 		 618 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  22.19 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  23.79 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1688  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000485496 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1498  glycosyl transferase family protein  24.09 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1481  glycosyl transferase family 2  24.32 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.935804  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  21.99 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2726  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  24.32 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  23.19 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  23.26 
 
 		 343 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0623  glycosyl transferase family protein  22.66 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000260018  hitchhiker  0.000000106889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  25.36 
 
 		 1231 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  23.43 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2356  glycosyl transferase family protein  20.98 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0790  glycosyl transferase family protein  24.72 
 
 		 342 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.68906  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>