108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3035 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3035  Ceramide glucosyltransferase  100 
 
 
387 aa  773    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1502  ceramide glucosyltransferase  71.51 
 
 
402 aa  484  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0451  ceramide glucosyltransferase  55.41 
 
 
424 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0687  Ceramide glucosyltransferase  32.11 
 
 
390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7359  ceramide glucosyltransferase  33.73 
 
 
380 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3673  ceramide glucosyltransferase  31.1 
 
 
368 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.081792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0714  ceramide glucosyltransferase  33.04 
 
 
394 aa  156  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.20894 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0727  Ceramide glucosyltransferase  32.74 
 
 
394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0130  Ceramide glucosyltransferase  32.63 
 
 
381 aa  153  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0822  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.9 
 
 
362 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6606  ceramide glucosyltransferase  31.49 
 
 
402 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0826  putative ceramide glucosyltransferase  31.36 
 
 
362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492531  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2152  ceramide glucosyltransferase  31.36 
 
 
362 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3865  ceramide glucosyltransferase  30.09 
 
 
382 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  28.24 
 
 
406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2068  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
424 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2195  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  26.14 
 
 
435 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02280  conserved hypothetical protein  22.93 
 
 
450 aa  99.8  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.380416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1031  ceramide glucosyltransferase  25.17 
 
 
404 aa  99.8  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0578  syl transferase, group 2 family protein  27.91 
 
 
392 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2860  syl transferase, group 2 family protein  27.24 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2853  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.91 
 
 
392 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2738  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.91 
 
 
392 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2797  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.91 
 
 
392 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1749  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.91 
 
 
392 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0723  ceramide glucosyltransferase, putative  26.4 
 
 
385 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3633  glycosyltransferase  26.93 
 
 
392 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0384  putative glycosyltransferase  27.68 
 
 
401 aa  96.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2815  ceramide glucosyltransferase, putative  24.8 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  24.8 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.569383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0943  glycosyltransferase  31.87 
 
 
405 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343577  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1780  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  28.99 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2121  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.99 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.557939  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0563  ceramide glucosyltransferase, putative  27.4 
 
 
380 aa  93.6  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0275595  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3407  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
380 aa  93.2  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1291  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  26.28 
 
 
392 aa  91.7  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522898  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20650  Glycosyl transferase, family 2  25.15 
 
 
386 aa  92  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0697  ceramide glucosyltransferase, putative  26.35 
 
 
399 aa  90.9  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1835  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.39 
 
 
397 aa  90.9  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4282  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
391 aa  89.7  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2200  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  25.85 
 
 
386 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2134  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  26.95 
 
 
392 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.771649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0691  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1170  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1146  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  26.72 
 
 
391 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.699851 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7079  putative (ceramide) glucosyltransferase  25.67 
 
 
404 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.806825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0888  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  26.06 
 
 
386 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0492799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0724  ceramide glucosyltransferase, putative  22.41 
 
 
417 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1766  syl transferase, group 2 family protein  27.74 
 
 
560 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.365362  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0471  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.75 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956035  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1052  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  25.82 
 
 
391 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0746  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0775  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117577  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1049  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3568  glycosyl transferase family 2  24.16 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72447 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1602  glycosyl transferase family 2  26.16 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2063  putative (ceramide) glucosyltransferase  24.92 
 
 
386 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.163903 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0896  glycosyltransferase  26.96 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0654391  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3357  ceramide glucosyltransferase, putative  23.99 
 
 
386 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178886  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5080  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  24.5 
 
 
389 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53942  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4954  glycosyl transferase family protein  21.7 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00767556  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0974  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  22.4 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4900  glycosyl transferase family protein  22.18 
 
 
368 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287952  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.21 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3350  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.2 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3123  glycosyl transferase family protein  22.74 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00523086  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3019  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.2 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2073  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.2 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3328  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.2 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0488  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.93 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0294  putative glycosyltransferase  24.66 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0308  putative glycosyltransferase  24.93 
 
 
422 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3653  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  23.6 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0400  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  22.83 
 
 
388 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.443716  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3454  putative glucosyltransferase  23.2 
 
 
398 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  0.104768 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3763  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  23.6 
 
 
398 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  21.61 
 
 
461 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5069  glycosyl transferase family 2  22.09 
 
 
391 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  23.04 
 
 
421 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 
752 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  22.61 
 
 
421 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  23.36 
 
 
418 aa  54.3  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  22.61 
 
 
421 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  24.32 
 
 
343 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
420 aa  52.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6338  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  25.66 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0080021 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0998  hypothetical protein  26.84 
 
 
306 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2582  hypothetical protein  25.19 
 
 
409 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0706725  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34303  ceramide glucosyltransferase  18.8 
 
 
520 aa  50.1  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  24.37 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7153  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  22.32 
 
 
395 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  24.16 
 
 
1099 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
495 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  19.72 
 
 
402 aa  47  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  21.01 
 
 
863 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  23.28 
 
 
442 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  21.01 
 
 
863 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  20.96 
 
 
862 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  21.23 
 
 
863 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>