165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3407 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3407  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 380 aa  763    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4900  glycosyl transferase family protein  69.62 
 
 		 368 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287952  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0578  syl transferase, group 2 family protein  53.46 
 
 		 392 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2853  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.46 
 
 		 392 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2738  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.46 
 
 		 392 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2797  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.46 
 
 		 392 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1749  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.46 
 
 		 392 aa  352  7e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20650  Glycosyl transferase, family 2  53.91 
 
 		 386 aa  349  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2860  syl transferase, group 2 family protein  53.32 
 
 		 393 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4282  glycosyl transferase family protein  55.52 
 
 		 391 aa  346  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1052  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  52.09 
 
 		 391 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1049  glycosyl transferase family protein  52.37 
 
 		 391 aa  342  8e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  51.85 
 
 		 406 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0691  glycosyl transferase family protein  54.94 
 
 		 391 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1170  glycosyl transferase family protein  54.94 
 
 		 391 aa  335  9e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2068  glycosyl transferase family protein  51.04 
 
 		 424 aa  328  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2134  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  52.37 
 
 		 392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.771649 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0384  putative glycosyltransferase  51.37 
 
 		 401 aa  325  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1146  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  60 
 
 		 391 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.699851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2195  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  53.3 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1766  syl transferase, group 2 family protein  59.86 
 
 		 560 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.365362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2815  ceramide glucosyltransferase, putative  40.23 
 
 		 391 aa  224  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1780  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  50.83 
 
 		 386 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2121  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.83 
 
 		 386 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.557939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1031  ceramide glucosyltransferase  38.87 
 
 		 404 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0697  ceramide glucosyltransferase, putative  40 
 
 		 399 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3454  putative glucosyltransferase  40.06 
 
 		 398 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  0.104768 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3763  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  45.1 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3123  glycosyl transferase family protein  41.67 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00523086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3653  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  39.94 
 
 		 398 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2063  putative (ceramide) glucosyltransferase  39.13 
 
 		 386 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.163903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7153  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  41.49 
 
 		 395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0974  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  43.77 
 
 		 402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6338  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  40 
 
 		 395 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0080021 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3350  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.94 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3019  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.94 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2073  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.94 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3328  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.94 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0488  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.94 
 
 		 415 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.73 
 
 		 415 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0294  putative glycosyltransferase  43.94 
 
 		 415 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0563  ceramide glucosyltransferase, putative  38.27 
 
 		 380 aa  209  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0275595  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2200  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  39.42 
 
 		 386 aa  209  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0308  putative glycosyltransferase  43.56 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1291  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  41.26 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3357  ceramide glucosyltransferase, putative  39.05 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0888  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  35.41 
 
 		 386 aa  206  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0492799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0724  ceramide glucosyltransferase, putative  33.91 
 
 		 417 aa  205  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0723  ceramide glucosyltransferase, putative  36.9 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7079  putative (ceramide) glucosyltransferase  39.03 
 
 		 404 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.806825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  36.28 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.569383  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1835  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  43.19 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3568  glycosyl transferase family 2  32.02 
 
 		 374 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5080  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  40.3 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5069  glycosyl transferase family 2  35.13 
 
 		 391 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1602  glycosyl transferase family 2  37.84 
 
 		 382 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0471  Acyl-CoA dehydrogenase-like  40.16 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0775  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 		 384 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0746  glycosyl transferase family 2  29.64 
 
 		 384 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4954  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 391 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00767556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0687  Ceramide glucosyltransferase  31.44 
 
 		 390 aa  126  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0130  Ceramide glucosyltransferase  30.79 
 
 		 381 aa  123  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0714  ceramide glucosyltransferase  30.75 
 
 		 394 aa  123  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.20894 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0727  Ceramide glucosyltransferase  30.75 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3673  ceramide glucosyltransferase  29.29 
 
 		 368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.081792 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0943  glycosyltransferase  39.38 
 
 		 405 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343577  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2152  ceramide glucosyltransferase  30.38 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0822  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.33 
 
 		 362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3633  glycosyltransferase  30.61 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7359  ceramide glucosyltransferase  32.63 
 
 		 380 aa  113  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0826  putative ceramide glucosyltransferase  30.09 
 
 		 362 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6606  ceramide glucosyltransferase  32.08 
 
 		 402 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0896  glycosyltransferase  37.31 
 
 		 405 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0654391  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3865  ceramide glucosyltransferase  33.33 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3035  Ceramide glucosyltransferase  27.94 
 
 		 387 aa  90.5  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0451  ceramide glucosyltransferase  26.44 
 
 		 424 aa  90.5  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02280  conserved hypothetical protein  34.38 
 
 		 450 aa  86.7  7e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.380416  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1502  ceramide glucosyltransferase  23.77 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 		 1231 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08806  ceramide glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09550)  30.07 
 
 		 618 aa  67.4  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3924  family 2 glycosyl transferase  25.22 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  23.62 
 
 		 980 aa  64.3  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2583  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  25.79 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  27 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0790  glycosyl transferase family protein  23.94 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.68906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30.34 
 
 		 1099 aa  57.8  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  23.34 
 
 		 509 aa  57  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  24.05 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  26.71 
 
 		 1101 aa  55.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0207  putative cellulose synthase protein  24.66 
 
 		 635 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.489481  normal  0.127812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0400  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  23.67 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.443716  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2582  hypothetical protein  27.18 
 
 		 409 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0706725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  27.71 
 
 		 752 aa  53.1  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  24.5 
 
 		 461 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  25.23 
 
 		 895 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  24.78 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2726  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4186  glycosyl transferase family 2  22.96 
 
 		 537 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>