221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0888 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3357  ceramide glucosyltransferase, putative  94.3 
 
 
386 aa  694    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0888  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  100 
 
 
386 aa  781    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0492799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2815  ceramide glucosyltransferase, putative  67.19 
 
 
391 aa  510  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1031  ceramide glucosyltransferase  64.12 
 
 
404 aa  500  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0697  ceramide glucosyltransferase, putative  66.48 
 
 
399 aa  477  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0563  ceramide glucosyltransferase, putative  58.68 
 
 
380 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0275595  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  55.79 
 
 
378 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.569383  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0723  ceramide glucosyltransferase, putative  39.05 
 
 
385 aa  263  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3123  glycosyl transferase family protein  37.95 
 
 
415 aa  237  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00523086  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0724  ceramide glucosyltransferase, putative  35.69 
 
 
417 aa  219  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0384  putative glycosyltransferase  40.71 
 
 
401 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1602  glycosyl transferase family 2  33.69 
 
 
382 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20650  Glycosyl transferase, family 2  36.03 
 
 
386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3568  glycosyl transferase family 2  34.54 
 
 
374 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3407  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 
380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  39.12 
 
 
406 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1291  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  39.58 
 
 
392 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522898  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2068  glycosyl transferase family protein  38.02 
 
 
424 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4900  glycosyl transferase family protein  37.99 
 
 
368 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287952  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4282  glycosyl transferase family protein  37.46 
 
 
391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1052  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  38.17 
 
 
391 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2063  putative (ceramide) glucosyltransferase  33.43 
 
 
386 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.163903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1049  glycosyl transferase family protein  37.87 
 
 
391 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2200  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  34.57 
 
 
386 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2195  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  36.55 
 
 
435 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0746  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 
384 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0775  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 
384 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117577  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0578  syl transferase, group 2 family protein  36.24 
 
 
392 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2853  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.24 
 
 
392 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2738  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.24 
 
 
392 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2797  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.24 
 
 
392 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1749  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.24 
 
 
392 aa  192  7e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2860  syl transferase, group 2 family protein  36.15 
 
 
393 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0691  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5069  glycosyl transferase family 2  34.5 
 
 
391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1170  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 
391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3653  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  35.43 
 
 
398 aa  190  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4954  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 
391 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00767556  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3454  putative glucosyltransferase  35.43 
 
 
398 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  0.104768 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1146  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  40.91 
 
 
391 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.699851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3763  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  35.43 
 
 
398 aa  187  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3350  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.66 
 
 
417 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3019  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.66 
 
 
417 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2073  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.66 
 
 
417 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3328  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.66 
 
 
417 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0488  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.66 
 
 
415 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0294  putative glycosyltransferase  34.38 
 
 
415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2134  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  43.15 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.771649 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0308  putative glycosyltransferase  34.38 
 
 
422 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6338  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  33.43 
 
 
395 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0080021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7153  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  33.04 
 
 
395 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7079  putative (ceramide) glucosyltransferase  32.95 
 
 
404 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.806825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.95 
 
 
415 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1766  syl transferase, group 2 family protein  35.81 
 
 
560 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.365362  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1835  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.24 
 
 
397 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0974  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  33.14 
 
 
402 aa  163  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1780  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  38.11 
 
 
386 aa  159  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2121  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.11 
 
 
386 aa  159  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.557939  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5080  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  30.85 
 
 
389 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53942  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3633  glycosyltransferase  33.16 
 
 
392 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0943  glycosyltransferase  30.7 
 
 
405 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343577  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0471  Acyl-CoA dehydrogenase-like  31.99 
 
 
389 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956035  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0896  glycosyltransferase  29.6 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0654391  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3673  ceramide glucosyltransferase  30.03 
 
 
368 aa  129  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.081792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0687  Ceramide glucosyltransferase  31.34 
 
 
390 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0714  ceramide glucosyltransferase  29.67 
 
 
394 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.20894 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0727  Ceramide glucosyltransferase  29.38 
 
 
394 aa  122  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3865  ceramide glucosyltransferase  32.91 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7359  ceramide glucosyltransferase  29.28 
 
 
380 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6606  ceramide glucosyltransferase  30.67 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2152  ceramide glucosyltransferase  31.97 
 
 
362 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0822  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.2 
 
 
362 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0130  Ceramide glucosyltransferase  30.29 
 
 
381 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0826  putative ceramide glucosyltransferase  31.45 
 
 
362 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492531  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02280  conserved hypothetical protein  22.73 
 
 
450 aa  86.7  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.380416  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3035  Ceramide glucosyltransferase  25.19 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0451  ceramide glucosyltransferase  24.81 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1502  ceramide glucosyltransferase  25.96 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  23.08 
 
 
1101 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3924  family 2 glycosyl transferase  22.7 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08806  ceramide glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09550)  23.52 
 
 
618 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2583  glycosyl transferase family protein  22.13 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8679  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34303  ceramide glucosyltransferase  33.33 
 
 
520 aa  67.4  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1246  glycosyl transferase family protein  22.98 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0864395  hitchhiker  0.00406978 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  25.69 
 
 
461 aa  62  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0447  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 
385 aa  60.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0126629  normal  0.0526051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2582  hypothetical protein  19.91 
 
 
409 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0706725  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  27.27 
 
 
716 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0400  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  21.52 
 
 
388 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.443716  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  25.69 
 
 
789 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  25.69 
 
 
789 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  25.69 
 
 
789 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  22.69 
 
 
429 aa  57  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 
617 aa  56.2  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 
658 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 
1267 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
1231 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  28.83 
 
 
659 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 
1140 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 
1140 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>