188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3357 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3357  ceramide glucosyltransferase, putative  100 
 
 
386 aa  780    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0888  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  94.3 
 
 
386 aa  683    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0492799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2815  ceramide glucosyltransferase, putative  67.45 
 
 
391 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1031  ceramide glucosyltransferase  64.1 
 
 
404 aa  500  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0697  ceramide glucosyltransferase, putative  66.94 
 
 
399 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0563  ceramide glucosyltransferase, putative  59.47 
 
 
380 aa  441  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0275595  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  56.17 
 
 
378 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.569383  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0723  ceramide glucosyltransferase, putative  39.05 
 
 
385 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3123  glycosyl transferase family protein  39.9 
 
 
415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00523086  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3407  glycosyl transferase family protein  39.17 
 
 
380 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20650  Glycosyl transferase, family 2  36.27 
 
 
386 aa  219  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3568  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 
374 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0384  putative glycosyltransferase  40.54 
 
 
401 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0724  ceramide glucosyltransferase, putative  35.4 
 
 
417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1602  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 
382 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1180  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  39.65 
 
 
406 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1291  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  38.51 
 
 
392 aa  208  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522898  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4282  glycosyl transferase family protein  39.76 
 
 
391 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533976  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2068  glycosyl transferase family protein  37.19 
 
 
424 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4900  glycosyl transferase family protein  37.99 
 
 
368 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287952  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1052  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  38.46 
 
 
391 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1049  glycosyl transferase family protein  38.55 
 
 
391 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2063  putative (ceramide) glucosyltransferase  32.5 
 
 
386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.163903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2195  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  35.96 
 
 
435 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0775  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
384 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117577  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0746  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
384 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2200  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  33.43 
 
 
386 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0691  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 
391 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1170  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 
391 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0578  syl transferase, group 2 family protein  36.34 
 
 
392 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2860  syl transferase, group 2 family protein  36.24 
 
 
393 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2853  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.34 
 
 
392 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2738  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.34 
 
 
392 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2797  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.34 
 
 
392 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.515623  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1749  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.34 
 
 
392 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3653  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  35.63 
 
 
398 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3454  putative glucosyltransferase  35.63 
 
 
398 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250583  normal  0.104768 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3763  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  35.63 
 
 
398 aa  189  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3350  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.47 
 
 
417 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0488  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.08 
 
 
415 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3019  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.47 
 
 
417 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2073  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.47 
 
 
417 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0294  putative glycosyltransferase  33.8 
 
 
415 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3328  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.47 
 
 
417 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2134  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  42.86 
 
 
392 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.771649 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1146  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  38.28 
 
 
391 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.699851 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5069  glycosyl transferase family 2  33.89 
 
 
391 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0308  putative glycosyltransferase  34.19 
 
 
422 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6338  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  33.05 
 
 
395 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0080021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7153  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  33.14 
 
 
395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4954  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
391 aa  181  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00767556  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.62 
 
 
415 aa  176  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7079  putative (ceramide) glucosyltransferase  32.43 
 
 
404 aa  176  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.806825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1766  syl transferase, group 2 family protein  36.49 
 
 
560 aa  169  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.365362  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0974  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  32.82 
 
 
402 aa  168  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2121  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.93 
 
 
386 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.557939  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1780  hopanoid biosynthesis associated glycosyl transferase protein HpnI  33.93 
 
 
386 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1835  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.67 
 
 
397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5080  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  31.4 
 
 
389 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53942  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3633  glycosyltransferase  33.77 
 
 
392 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0471  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.01 
 
 
389 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956035  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0943  glycosyltransferase  31.29 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.343577  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0896  glycosyltransferase  29.82 
 
 
405 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0654391  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0687  Ceramide glucosyltransferase  29.73 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0714  ceramide glucosyltransferase  29.67 
 
 
394 aa  127  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.20894 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0727  Ceramide glucosyltransferase  29.38 
 
 
394 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3673  ceramide glucosyltransferase  28.91 
 
 
368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.081792 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3865  ceramide glucosyltransferase  30.47 
 
 
382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6606  ceramide glucosyltransferase  27.38 
 
 
402 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7359  ceramide glucosyltransferase  28.32 
 
 
380 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0130  Ceramide glucosyltransferase  30.29 
 
 
381 aa  106  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2152  ceramide glucosyltransferase  31.56 
 
 
362 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0822  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.8 
 
 
362 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0826  putative ceramide glucosyltransferase  31.05 
 
 
362 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492531  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02280  conserved hypothetical protein  24 
 
 
450 aa  93.2  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.380416  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0451  ceramide glucosyltransferase  25.4 
 
 
424 aa  78.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3035  Ceramide glucosyltransferase  24.71 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1502  ceramide glucosyltransferase  25.53 
 
 
402 aa  75.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08806  ceramide glucosyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09550)  24.15 
 
 
618 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34303  ceramide glucosyltransferase  35.04 
 
 
520 aa  70.9  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3924  family 2 glycosyl transferase  21.63 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  22.69 
 
 
1101 aa  67.8  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2583  glycosyl transferase family protein  21.34 
 
 
419 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8679  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1246  glycosyl transferase family protein  23.39 
 
 
388 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0864395  hitchhiker  0.00406978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0447  glycosyl transferase family protein  23.79 
 
 
385 aa  63.2  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0126629  normal  0.0526051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  24.37 
 
 
789 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  24.37 
 
 
789 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  24.37 
 
 
789 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1394  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  23.35 
 
 
392 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00767867  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2582  hypothetical protein  21 
 
 
409 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0706725  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  24.9 
 
 
461 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
473 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  26.7 
 
 
716 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 
617 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  23 
 
 
402 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2726  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
395 aa  54.3  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0400  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  21.69 
 
 
388 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.443716  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  22.27 
 
 
429 aa  53.9  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 
658 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 
1267 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>