110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2659 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  57.75 
 
 
698 aa  734    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2659  bacteriophage N4 adsorption protein B  100 
 
 
653 aa  1351    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  58.07 
 
 
703 aa  747    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  58.07 
 
 
703 aa  747    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1194  bacteriophage N4 adsorption protein B  41.83 
 
 
706 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1030  bacteriophage N4 adsorption protein B  42.34 
 
 
706 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196607  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1734  bacteriophage N4 adsorption protein B  43 
 
 
713 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0567  bacteriophage N4 adsorption protein B  42.99 
 
 
715 aa  464  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2943  bacteriophage N4 adsorption protein B  45.14 
 
 
573 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493194  normal  0.195139 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3060  General secretory system II protein E domain protein  37.96 
 
 
745 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0586  bacteriophage N4 adsorption protein B  40.77 
 
 
745 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437214  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0642  bacteriophage N4 adsorption protein B  37.96 
 
 
745 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3083  bacteriophage N4 adsorption protein B  40.96 
 
 
745 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2524  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.05 
 
 
736 aa  392  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2724  bacteriophage N4 adsorption protein B  40.38 
 
 
497 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193834  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2488  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.94 
 
 
724 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916644  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2932  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.6 
 
 
724 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748397  normal  0.174215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3448  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.77 
 
 
724 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1710  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.41 
 
 
724 aa  342  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2152  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.54 
 
 
502 aa  323  6e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.518068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2242  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.97 
 
 
502 aa  323  6e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0150202  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1309  bacteriophage N4 receptor, inner membrane subunit  31.33 
 
 
542 aa  217  5e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.140023 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0601  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.41 
 
 
483 aa  216  9e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3312  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.62 
 
 
442 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2548  general secretion pathway protein E  31.39 
 
 
442 aa  203  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2644  bacteriophage N4 adsorption protein B  37.8 
 
 
488 aa  190  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1755  bacteriophage N4 adsorption protein B  30.96 
 
 
670 aa  184  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660131  normal  0.0589931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1600  bacteriophage N4 adsorption protein B  26.63 
 
 
711 aa  181  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.443209  hitchhiker  0.00000043363 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  30.94 
 
 
561 aa  72.4  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.47 
 
 
571 aa  62.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1135  response regulator receiver protein  27.66 
 
 
283 aa  61.2  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1737  response regulator receiver domain-containing protein  28.67 
 
 
277 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.570794  normal  0.630295 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  29.52 
 
 
554 aa  59.7  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3127  response regulator receiver protein  27.66 
 
 
283 aa  59.7  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  26.28 
 
 
569 aa  58.9  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  36.84 
 
 
574 aa  57.4  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  29.46 
 
 
562 aa  54.3  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  29.46 
 
 
563 aa  54.7  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  30.6 
 
 
559 aa  54.3  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  29.66 
 
 
585 aa  54.3  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.88 
 
 
568 aa  53.9  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  25.87 
 
 
574 aa  53.9  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  29.05 
 
 
606 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  23.7 
 
 
492 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  26.57 
 
 
578 aa  53.5  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0022  General secretory system II protein E domain protein  29.56 
 
 
244 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2989  type II secretion system protein E  29.8 
 
 
636 aa  53.9  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  29.93 
 
 
553 aa  52.8  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  29.86 
 
 
564 aa  52  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  31.91 
 
 
553 aa  51.6  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  28.3 
 
 
570 aa  51.6  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  36 
 
 
567 aa  51.2  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  26.69 
 
 
1101 aa  50.8  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  29.29 
 
 
561 aa  50.4  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  28.43 
 
 
558 aa  50.4  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  33.33 
 
 
575 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4273  general secretion pathway protein E  28.68 
 
 
552 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  28.3 
 
 
577 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.48 
 
 
656 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  28.16 
 
 
841 aa  49.7  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  35 
 
 
566 aa  49.7  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  27.62 
 
 
567 aa  48.9  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  32.08 
 
 
561 aa  48.5  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  26.67 
 
 
787 aa  48.5  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.89 
 
 
573 aa  48.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  26.28 
 
 
568 aa  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  29.45 
 
 
573 aa  48.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  29.71 
 
 
556 aa  48.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  29.25 
 
 
574 aa  47.8  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  21.36 
 
 
425 aa  47.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  33.91 
 
 
612 aa  47.8  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1220  response regulator  24.64 
 
 
277 aa  47.8  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.327631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  29.29 
 
 
576 aa  47.4  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  27.54 
 
 
568 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  33.91 
 
 
599 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2299  response regulator receiver protein  25 
 
 
275 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  29.5 
 
 
571 aa  47  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  27.27 
 
 
574 aa  47  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  23.74 
 
 
431 aa  46.6  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  32.69 
 
 
574 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  25.74 
 
 
566 aa  46.2  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  34.44 
 
 
370 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  29.9 
 
 
582 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  30.77 
 
 
573 aa  46.2  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  26.15 
 
 
573 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  33.91 
 
 
599 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  26.24 
 
 
568 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  26.42 
 
 
586 aa  45.8  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  25.48 
 
 
558 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  33.91 
 
 
599 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  29.77 
 
 
547 aa  45.8  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.12 
 
 
630 aa  45.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  27.69 
 
 
577 aa  45.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  27.93 
 
 
589 aa  45.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  28.08 
 
 
577 aa  45.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  32.14 
 
 
561 aa  45.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  34.43 
 
 
570 aa  45.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.73 
 
 
568 aa  44.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.73 
 
 
568 aa  44.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  27.16 
 
 
570 aa  44.3  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>