68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2242 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2152  bacteriophage N4 adsorption protein B  98.8 
 
 		 502 aa  996    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.518068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2242  bacteriophage N4 adsorption protein B  100 
 
 		 502 aa  1008    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0150202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2943  bacteriophage N4 adsorption protein B  41.54 
 
 		 573 aa  333  6e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493194  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1194  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.96 
 
 		 706 aa  332  9e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0726251  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2659  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.09 
 
 		 653 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.397529 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1030  bacteriophage N4 adsorption protein B  37.96 
 
 		 706 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.196607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0567  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.79 
 
 		 715 aa  316  7e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.62 
 
 		 703 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.62 
 
 		 703 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1734  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.53 
 
 		 713 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2724  bacteriophage N4 adsorption protein B  39 
 
 		 497 aa  310  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193834  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0508  bacteriophage N4 adsorption protein B  38.75 
 
 		 698 aa  310  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.759606  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3060  General secretory system II protein E domain protein  36.03 
 
 		 745 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0642  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.03 
 
 		 745 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0586  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.03 
 
 		 745 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3083  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.03 
 
 		 745 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2524  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.85 
 
 		 736 aa  280  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2488  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.48 
 
 		 724 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000916644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2932  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.31 
 
 		 724 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.748397  normal  0.174215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3448  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.65 
 
 		 724 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1710  bacteriophage N4 adsorption protein B  37 
 
 		 724 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3312  bacteriophage N4 adsorption protein B  35.04 
 
 		 442 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1309  bacteriophage N4 receptor, inner membrane subunit  35.08 
 
 		 542 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.140023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2548  general secretion pathway protein E  33.85 
 
 		 442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0601  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.68 
 
 		 483 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1755  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.53 
 
 		 670 aa  212  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660131  normal  0.0589931 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2644  bacteriophage N4 adsorption protein B  36.44 
 
 		 488 aa  198  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1600  bacteriophage N4 adsorption protein B  33.97 
 
 		 711 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.443209  hitchhiker  0.00000043363 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  25.72 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 		 654 aa  65.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  25.38 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  25.08 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  25.82 
 
 		 417 aa  62  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 		 537 aa  60.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.17 
 
 		 573 aa  59.7  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  25.64 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  23.7 
 
 		 698 aa  59.3  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.86 
 
 		 630 aa  58.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  25.55 
 
 		 664 aa  58.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  22.56 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 		 604 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 		 509 aa  56.2  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  23.66 
 
 		 626 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  23.01 
 
 		 664 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  24.82 
 
 		 636 aa  54.3  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.25 
 
 		 532 aa  52.8  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  25 
 
 		 606 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  24.52 
 
 		 686 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 		 616 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 		 683 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.66 
 
 		 656 aa  51.2  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  24.52 
 
 		 612 aa  51.2  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  24.04 
 
 		 628 aa  51.6  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  21.43 
 
 		 848 aa  51.2  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  24.35 
 
 		 512 aa  50.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  25.48 
 
 		 492 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  24.82 
 
 		 673 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 		 476 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  23.55 
 
 		 642 aa  47.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 		 417 aa  47  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 		 596 aa  47  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 		 614 aa  47  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  25.18 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.959735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  24.51 
 
 		 789 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  24.51 
 
 		 789 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  24.51 
 
 		 789 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 		 678 aa  43.5  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>