More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0557 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0557  response regulator receiver protein  100 
 
 
125 aa  248  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1833  putative diguanylate phosphodiesterase  38.3 
 
 
566 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2679  response regulator receiver domain-containing protein  33.05 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.380915  normal  0.27601 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1766  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  38.3 
 
 
554 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.449709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 
822 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3189  twitching motility protein  31.86 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.612166  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4293  response regulator receiver domain-containing protein  35.14 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.9 
 
 
456 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  31.53 
 
 
121 aa  67  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  37.04 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 
795 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524225  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  30.51 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 
821 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0237  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
440 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
1076 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.04 
 
 
470 aa  63.9  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
581 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3696  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.21 
 
 
458 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12736  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4371  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.21 
 
 
451 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109269  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
245 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
740 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2980  response regulator receiver protein  34.78 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
1415 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.63 
 
 
229 aa  62  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0819  LuxR family two component transcriptional regulator  37.5 
 
 
227 aa  62  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.633548  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1496  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.21 
 
 
451 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190196  normal  0.699272 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 
1002 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2034  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.83 
 
 
449 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792682  normal  0.101595 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.75 
 
 
869 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  28.21 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3767  response regulator receiver protein  33.06 
 
 
124 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0858272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  27.97 
 
 
120 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  28.21 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 
237 aa  62  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0513  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.17 
 
 
228 aa  61.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  30.25 
 
 
122 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2576  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 
840 aa  61.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0149194 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1117  response regulator  31.62 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 
381 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  29.91 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 
1385 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3932  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 
451 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215439  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0479  response regulator receiver protein  28.81 
 
 
120 aa  60.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 
1011 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 
703 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  29 
 
 
798 aa  60.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
1352 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3460  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.5 
 
 
444 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0376131  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001908  nitrogen regulation protein NR(I)  29.17 
 
 
467 aa  60.1  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
708 aa  60.5  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
756 aa  60.1  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00584  response regulator  29.17 
 
 
467 aa  60.5  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2514  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.15 
 
 
869 aa  59.3  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4110  response regulator receiver protein  30.43 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1993  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.66 
 
 
486 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1377  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.9 
 
 
462 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244526  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 
732 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  28.83 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  27.35 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3169  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.25 
 
 
444 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254755  normal  0.187976 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
1390 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
1390 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  33.93 
 
 
225 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 
706 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  36 
 
 
1478 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 
1057 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
1390 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2171  response regulator receiver protein  40.51 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.8 
 
 
459 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0538681  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3353  response regulator receiver protein  26.5 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.392561  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2037  response regulator receiver protein  28.81 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0999958  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  34.78 
 
 
226 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1312  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.83 
 
 
455 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.502008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 
963 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
1297 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2398  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.09 
 
 
469 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.313034  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  31.09 
 
 
606 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0513  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 
803 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.883754  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2064  response regulator receiver protein  29.06 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.44 
 
 
364 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  30.77 
 
 
1427 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1732  response regulator receiver protein  31.67 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2310  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.09 
 
 
469 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1655  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.09 
 
 
462 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000025661  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4405  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  29.91 
 
 
448 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.851623  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0154  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.74 
 
 
220 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.443854  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  33.91 
 
 
226 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1316  response regulator  30 
 
 
324 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 
809 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0581395 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.09 
 
 
467 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1016  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 
243 aa  58.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  34.48 
 
 
1643 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2445  response regulator receiver  29.03 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.942791  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2815  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 
238 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180318  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  30.65 
 
 
571 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
1059 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  30.83 
 
 
1236 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3705  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.26 
 
 
628 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.567264  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>