More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4293 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4293  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  283  7e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3108  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 122 aa  100  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6062  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  39.32 
 
 		 121 aa  90.5  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2099  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  34.43 
 
 		 402 aa  90.1  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1431  response regulator receiver  37.84 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 121 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 126 aa  89  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  37.84 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  37.84 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 1352 aa  89  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0748  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.390262  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0134  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.81317  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6680  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 126 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  37.84 
 
 		 121 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3950  histidine kinase  36.75 
 
 		 589 aa  87.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.365281 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5086  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.88 
 
 		 465 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1276  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.107336  normal  0.0271474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7418  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.149776  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1347  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 123 aa  87  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57835  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  34.45 
 
 		 265 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1243  response regulator receiver domain-containing protein  32.48 
 
 		 121 aa  85.9  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.253807 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2443  response regulator receiver domain-containing protein  36.94 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377248  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  37.72 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  34.19 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2804  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.07 
 
 		 1977 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  36.04 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 127 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 252 aa  84.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 1322 aa  84.3  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 249 aa  84.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 123 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2789  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 122 aa  84  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  36.75 
 
 		 243 aa  84  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2814  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212392  normal  0.180632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 241 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1494  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 138 aa  83.6  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 935 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1381  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1289  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0254052  hitchhiker  0.00394342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3877  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1865  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.111325  normal  0.212824 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0966  response regulator receiver  33.62 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.734958  normal  0.0218415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1051  response regulator receiver  36.7 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 1274 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2998  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 807 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.745142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2781  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0906  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0687715  normal  0.223091 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3763  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 		 964 aa  82  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1751  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.21 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0612  polar differentiation response regulator  36.45 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 939 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4908  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00100675  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 664 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1212  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4080  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 222 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.542388  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 721 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1124  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.94 
 
 		 502 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.963767  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 397 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  35 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0576  polar differentiation response regulator  36.45 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3678  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.716343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2997  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0849  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.87 
 
 		 593 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.386146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0820  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.87 
 
 		 593 aa  81.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5319  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0886883  normal  0.780288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 777 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0423  response regulator receiver protein  36.45 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.89687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0930  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.41216  normal  0.177566 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3382  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 241 aa  80.5  0.000000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98781 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0903  cell division response regulator DivK  35.19 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.91869  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  34.91 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0604  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.72319  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 225 aa  80.1  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 801 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 811 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 393 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0825  response regulator receiver  33.33 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 1271 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 531 aa  79.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0452  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.17051  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26471  two-component response regulator  33.63 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.889517 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  30.17 
 
 		 1127 aa  79.3  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2620  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 532 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.59 
 
 		 412 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 		 947 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.43 
 
 		 1131 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22940  two-component response regulator GltR  35.09 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.281067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3308  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.678314  normal  0.215079 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.31 
 
 		 1053 aa  78.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.41 
 
 		 1177 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>