70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1908 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 
115 aa  223  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  72.17 
 
 
115 aa  174  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  37.72 
 
 
121 aa  84  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  36.52 
 
 
114 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0933  roadblock/LC7 family protein  35.09 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0781277  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  34.78 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  34.78 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  33.91 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  31.3 
 
 
114 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1376  Roadblock/LC7 family protein  34.48 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0196587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3343  roadblock/LC7 family protein  37.61 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1151  Roadblock/LC7 family protein  36.21 
 
 
117 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.210812 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1132  Roadblock/LC7 family protein  33.96 
 
 
118 aa  63.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2475  hypothetical protein  34.95 
 
 
258 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  30.43 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  30.43 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3142  roadblock/LC7 family protein  34.26 
 
 
265 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  28.07 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  28.95 
 
 
115 aa  57  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  33.04 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  29.35 
 
 
125 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  32.11 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  29.46 
 
 
135 aa  50.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  31.37 
 
 
230 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  30.28 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1020  hypothetical protein  28.43 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0409339  hitchhiker  0.000000330929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  26.26 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  27.68 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  27.1 
 
 
119 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  28.44 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  26.32 
 
 
120 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  29.25 
 
 
130 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1005  roadblock/LC7 family protein  32.08 
 
 
223 aa  46.2  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0861653  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  26.17 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  28.41 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  30.28 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  31.3 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  33.98 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  27.68 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1018  roadblock/LC7 domain-contain protein  30.1 
 
 
116 aa  45.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00111264  hitchhiker  0.000000321454 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  29.46 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  25.51 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  25.25 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  27.1 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  27.1 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  28.95 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  25.77 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  28.57 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  30.43 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  30.36 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  27.93 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  25.77 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  32.38 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  30.77 
 
 
149 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  28.3 
 
 
139 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  28.04 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  27.17 
 
 
122 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  30.7 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  28.85 
 
 
119 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  31.25 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  31.25 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  31.25 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  31.82 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1029  roadblock/LC7 family protein  27.96 
 
 
114 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  25.89 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  28.81 
 
 
122 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  28.44 
 
 
141 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  28 
 
 
144 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  27.03 
 
 
133 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>