56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0335 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 122 aa  238  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  97.54 
 
 		 122 aa  232  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  88.52 
 
 		 122 aa  214  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  84.43 
 
 		 122 aa  203  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  56.3 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  52.1 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  55.65 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  54.78 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  55.24 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  55.86 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  55.86 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  53.33 
 
 		 122 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  51.72 
 
 		 230 aa  110  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  51.04 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  51.04 
 
 		 119 aa  101  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  50 
 
 		 277 aa  100  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1029  roadblock/LC7 family protein  42.34 
 
 		 114 aa  94.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  39.42 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  31.9 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  36 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0565  Roadblock/LC7 family protein  39.56 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  34.31 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0401  roadblock/LC7 domain protein  39.76 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3233  roadblock/LC7 family protein  31.71 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.589466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  33.01 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  32.67 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  32.67 
 
 		 114 aa  62  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  29.37 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  38.3 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2217  roadblock/LC7 domain-contain protein  31.25 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129735  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  34.51 
 
 		 139 aa  50.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7712  hypothetical protein  32.73 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  37.08 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  34.74 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  34.74 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  30.7 
 
 		 121 aa  47.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  31.91 
 
 		 140 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  30.93 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  32.98 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  32.58 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  34.78 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  25.25 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1348  roadblock/LC7 family protein  25.96 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  31.91 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  32.29 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4122  Roadblock/LC7 family protein  32.95 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  22.77 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  34.88 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  34.29 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  35.11 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  33.72 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  29.79 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  18.58 
 
 		 115 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  29.89 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>