108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5471 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 147 aa  301  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  47.14 
 
 		 141 aa  133  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  44.85 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  44.53 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  43.57 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  47.62 
 
 		 133 aa  120  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  44.62 
 
 		 140 aa  120  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  43.85 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  47.2 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  43.85 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  43.65 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  46.4 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  44.62 
 
 		 140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  44.44 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  44.06 
 
 		 147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  43.65 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  44 
 
 		 140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  42.86 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  43.61 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  41.27 
 
 		 148 aa  103  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  40.94 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  42.11 
 
 		 138 aa  100  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  43.85 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  42.74 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  40.15 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  42.74 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  37.23 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  37.23 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  37.23 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  40.91 
 
 		 139 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  39.68 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  41.18 
 
 		 131 aa  96.7  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  40.77 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  40.34 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  39.02 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  36.51 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  38.21 
 
 		 135 aa  94  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  35.71 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  35.66 
 
 		 149 aa  93.6  9e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  38.57 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  37.14 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  37.59 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  34.56 
 
 		 138 aa  89.4  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  35.2 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  39.52 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  35.71 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  38.17 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  39.84 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  36.59 
 
 		 140 aa  86.7  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  37.6 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  33.82 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  35.77 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  36.07 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  36.03 
 
 		 145 aa  83.6  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  38.28 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  37.5 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  34.33 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  34.33 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  35.38 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  31.2 
 
 		 143 aa  80.5  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  32.84 
 
 		 145 aa  80.5  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  33.61 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  80.1  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  34.4 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  41.09 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  36.22 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  32.8 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  33.85 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  32.33 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  35.61 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  34.96 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  34.68 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  36.43 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  33.05 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  33.86 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  29.03 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  38.06 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  34.21 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  31.71 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  35.45 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  35.11 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  28.83 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  29.84 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  32.31 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  32.26 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  33.59 
 
 		 142 aa  60.1  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  28.07 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  38.6 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  29.37 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  30.28 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  29.36 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  35.23 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  36.17 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4122  Roadblock/LC7 family protein  31.31 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  26.85 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  26.85 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  34.88 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  32.95 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>