103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3194 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  281  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  73.48 
 
 
139 aa  194  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  67.44 
 
 
136 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  63.36 
 
 
140 aa  159  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  61.07 
 
 
140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  58.73 
 
 
142 aa  148  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  59.69 
 
 
141 aa  148  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  56.45 
 
 
129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  54.76 
 
 
135 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  59.02 
 
 
140 aa  142  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  54.69 
 
 
143 aa  140  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  55.38 
 
 
135 aa  140  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  50 
 
 
143 aa  138  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  56.15 
 
 
139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  56.1 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  54.84 
 
 
139 aa  131  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  48.48 
 
 
138 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  54.76 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  51.16 
 
 
136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  52.38 
 
 
139 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  51.59 
 
 
139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  60.68 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  48 
 
 
133 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  49.19 
 
 
133 aa  114  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  45.67 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  49.21 
 
 
151 aa  114  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  46.62 
 
 
133 aa  114  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  50 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  48.41 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  43.48 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  47.83 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  43.94 
 
 
140 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  46.72 
 
 
142 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  44.2 
 
 
149 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  46.03 
 
 
135 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  43.18 
 
 
149 aa  104  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  47.06 
 
 
140 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  46.72 
 
 
140 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  45.08 
 
 
140 aa  102  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  44.54 
 
 
149 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  46.72 
 
 
139 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  44.8 
 
 
150 aa  101  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  43.48 
 
 
144 aa  100  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  45.16 
 
 
134 aa  99.4  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  44.88 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  46.22 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  44.19 
 
 
168 aa  98.6  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  44.07 
 
 
148 aa  97.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  39.53 
 
 
147 aa  97.1  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  43.9 
 
 
137 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  43.2 
 
 
129 aa  96.7  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  43.2 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  44.07 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  40 
 
 
137 aa  94.4  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  42.62 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  42.62 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  42.62 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  44.54 
 
 
140 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  42.75 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  46.34 
 
 
136 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  42.02 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  45.9 
 
 
140 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  43.33 
 
 
141 aa  92  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  42.06 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  42.64 
 
 
134 aa  90.9  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  42.52 
 
 
135 aa  90.1  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  41.09 
 
 
135 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  41.46 
 
 
138 aa  87.8  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  40.15 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  37.6 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  39.02 
 
 
130 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  43.08 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  42.28 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  36.89 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  36.8 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  39.02 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  38.98 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  32.79 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  40 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  36.36 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  33.06 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  36.43 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  36 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  35.96 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  31.97 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  36 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  37.4 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  37.19 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  37.1 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  33.9 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  33.63 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  32.06 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  31.58 
 
 
119 aa  49.7  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  30.97 
 
 
119 aa  48.1  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  28.87 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  30.69 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  31.68 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  30.69 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  31.11 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>