98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7863 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 
142 aa  281  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  81.02 
 
 
140 aa  227  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  81.02 
 
 
140 aa  224  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  77.54 
 
 
140 aa  221  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  71.22 
 
 
140 aa  203  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  71.74 
 
 
140 aa  195  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  73.68 
 
 
139 aa  194  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  74.22 
 
 
133 aa  194  5.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  70.45 
 
 
135 aa  192  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  73.19 
 
 
140 aa  192  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  71.88 
 
 
133 aa  186  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  68.35 
 
 
139 aa  186  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  70.63 
 
 
139 aa  179  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  68.75 
 
 
151 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  71.77 
 
 
134 aa  177  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  71.77 
 
 
134 aa  176  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  67.19 
 
 
150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  68.29 
 
 
139 aa  171  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  62.31 
 
 
140 aa  165  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  60.47 
 
 
138 aa  161  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  58.09 
 
 
149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  57.81 
 
 
147 aa  159  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  58.09 
 
 
149 aa  159  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  57.35 
 
 
149 aa  157  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  56.62 
 
 
148 aa  156  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  59.4 
 
 
135 aa  155  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  57.25 
 
 
135 aa  155  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  53.68 
 
 
149 aa  149  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  62.12 
 
 
139 aa  147  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  52.9 
 
 
138 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  52.9 
 
 
138 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  52.9 
 
 
138 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  55.91 
 
 
129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  58.68 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  59.02 
 
 
134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  59.85 
 
 
139 aa  142  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  56.56 
 
 
139 aa  140  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  51.15 
 
 
137 aa  136  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  53.79 
 
 
141 aa  135  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  49.23 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  47.1 
 
 
138 aa  125  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  47.66 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  44.19 
 
 
136 aa  124  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  50.41 
 
 
142 aa  123  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  50.39 
 
 
139 aa  123  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  53.39 
 
 
140 aa  121  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  42.14 
 
 
142 aa  121  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  43.57 
 
 
147 aa  121  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  43.08 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  43.75 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  48.36 
 
 
135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  48.09 
 
 
135 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  44.06 
 
 
145 aa  117  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  50.85 
 
 
140 aa  117  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  50.81 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  47.37 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  45.8 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  44.62 
 
 
146 aa  111  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  47.54 
 
 
129 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  42.96 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  44.7 
 
 
168 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  44.54 
 
 
131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  41.46 
 
 
131 aa  107  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  47.97 
 
 
139 aa  106  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  46.72 
 
 
142 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  42.97 
 
 
136 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  45.9 
 
 
136 aa  105  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  44.74 
 
 
137 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  49.23 
 
 
136 aa  104  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  46.4 
 
 
145 aa  103  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  42.74 
 
 
137 aa  101  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  43.85 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  38.64 
 
 
138 aa  94.4  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  43.31 
 
 
139 aa  94.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  46.4 
 
 
144 aa  93.6  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  41.6 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  41.46 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  43.86 
 
 
133 aa  92  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  37.7 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  41.01 
 
 
150 aa  90.9  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  35.46 
 
 
165 aa  90.9  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  37.5 
 
 
146 aa  90.1  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  40.17 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  43.44 
 
 
130 aa  87.4  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  50.45 
 
 
144 aa  87  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  44.36 
 
 
152 aa  87  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  41.27 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  36.52 
 
 
143 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  38.46 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  35.66 
 
 
129 aa  72.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  41.23 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  33.87 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  32.03 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  31.5 
 
 
230 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  29.63 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  29.73 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  28.83 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  30.51 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>