104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3809 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 
136 aa  267  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  68.38 
 
 
141 aa  183  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  64.18 
 
 
139 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  67.44 
 
 
142 aa  178  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  64.89 
 
 
135 aa  168  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  64.8 
 
 
135 aa  164  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  60.77 
 
 
142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  62.41 
 
 
140 aa  161  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  61.65 
 
 
140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  62.9 
 
 
129 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  58.33 
 
 
139 aa  155  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  59.84 
 
 
151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  60 
 
 
139 aa  149  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  60.98 
 
 
136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  55.3 
 
 
138 aa  144  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  53.12 
 
 
143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  50.39 
 
 
143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  56.8 
 
 
146 aa  142  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  52.67 
 
 
140 aa  140  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  53.79 
 
 
133 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  51.88 
 
 
151 aa  131  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  54.47 
 
 
149 aa  130  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  48.53 
 
 
150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  52.94 
 
 
139 aa  123  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  60.36 
 
 
144 aa  123  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  52.21 
 
 
139 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  51.91 
 
 
144 aa  122  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  47.58 
 
 
133 aa  120  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  48.06 
 
 
139 aa  120  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  46.4 
 
 
133 aa  120  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  47.29 
 
 
139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  49.18 
 
 
139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  46.97 
 
 
168 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  48.09 
 
 
143 aa  118  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  50.4 
 
 
137 aa  116  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  47.66 
 
 
134 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  47.37 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  50.81 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  47.15 
 
 
140 aa  114  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  45.8 
 
 
140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  45.8 
 
 
140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  50 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  46.88 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  47.66 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  46.9 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  48.33 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  45.13 
 
 
149 aa  110  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  42.19 
 
 
149 aa  110  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  48.84 
 
 
138 aa  110  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  50.41 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  44.27 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  43.41 
 
 
147 aa  107  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  45.6 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  46.03 
 
 
138 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  46.03 
 
 
138 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  46.03 
 
 
138 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  43.85 
 
 
137 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  43.55 
 
 
129 aa  104  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  47.33 
 
 
136 aa  104  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  46.36 
 
 
148 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  48.12 
 
 
142 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  46.4 
 
 
140 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  44.14 
 
 
149 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  52.07 
 
 
140 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  44.35 
 
 
138 aa  98.2  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  40.91 
 
 
135 aa  97.8  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  40.77 
 
 
135 aa  97.1  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  44 
 
 
131 aa  96.7  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  48.41 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  40.77 
 
 
139 aa  94  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  37.3 
 
 
141 aa  94  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  41.74 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  42.52 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  43.8 
 
 
134 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  41.67 
 
 
141 aa  90.5  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  35.48 
 
 
143 aa  90.1  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  39.34 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  39.52 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  42.31 
 
 
141 aa  87.8  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  41.32 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  36.51 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  38.84 
 
 
165 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  35.48 
 
 
131 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  37.7 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  39.02 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  38.17 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  35.43 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  32.06 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  34.21 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  36.59 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  33.59 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  35.24 
 
 
140 aa  67  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  33.06 
 
 
146 aa  67  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  31.2 
 
 
230 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  32.18 
 
 
148 aa  47  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1029  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  29.7 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  32.98 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  27.84 
 
 
120 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  31.68 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>