94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0761 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 
134 aa  262  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  98.51 
 
 
134 aa  260  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  87.3 
 
 
139 aa  223  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  79.2 
 
 
135 aa  195  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  77.95 
 
 
135 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  72.36 
 
 
139 aa  181  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  72.44 
 
 
140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  72.8 
 
 
150 aa  178  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  72.44 
 
 
140 aa  177  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  71.77 
 
 
142 aa  176  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  70.73 
 
 
139 aa  176  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  73.33 
 
 
151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  66.13 
 
 
140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  66.39 
 
 
147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  69.11 
 
 
133 aa  164  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  66.4 
 
 
133 aa  163  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  60.47 
 
 
138 aa  159  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  60.47 
 
 
138 aa  159  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  60.47 
 
 
138 aa  159  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  64.34 
 
 
135 aa  158  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  65.57 
 
 
140 aa  157  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  63.64 
 
 
129 aa  156  8e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  62.3 
 
 
140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  64.6 
 
 
130 aa  147  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  60.33 
 
 
137 aa  147  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  62.5 
 
 
140 aa  147  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  63.71 
 
 
140 aa  146  8e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  60.48 
 
 
139 aa  145  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  57.26 
 
 
149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  58.87 
 
 
149 aa  144  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  58.87 
 
 
149 aa  144  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  55.65 
 
 
149 aa  137  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  55.47 
 
 
139 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  57.5 
 
 
148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  52.27 
 
 
145 aa  131  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  55.37 
 
 
138 aa  131  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  49.6 
 
 
136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  54.55 
 
 
134 aa  127  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  50.79 
 
 
138 aa  125  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  53.6 
 
 
139 aa  122  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  52.8 
 
 
139 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  48.41 
 
 
135 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  46.83 
 
 
140 aa  121  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  45.52 
 
 
142 aa  121  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  47.29 
 
 
146 aa  121  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  48.41 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  46.56 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  50.44 
 
 
137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  48.41 
 
 
143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  55.28 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  47.58 
 
 
151 aa  116  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  45.67 
 
 
135 aa  116  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  50.79 
 
 
140 aa  116  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  49.19 
 
 
129 aa  115  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  47.66 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  48.36 
 
 
139 aa  114  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  49.58 
 
 
131 aa  113  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  49.21 
 
 
140 aa  113  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  47.66 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  47.29 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  50.41 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  42.86 
 
 
143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  46.03 
 
 
139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  46.92 
 
 
136 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  44.62 
 
 
139 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  43.18 
 
 
141 aa  101  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  43.09 
 
 
136 aa  100  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  42.97 
 
 
138 aa  99.4  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  42.98 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  44.88 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  42.74 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  43.75 
 
 
168 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  42.52 
 
 
141 aa  97.1  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  44.8 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  41.54 
 
 
137 aa  93.2  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  41.94 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  42.52 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  46.46 
 
 
136 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  44.62 
 
 
144 aa  90.5  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  46.51 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  40.8 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  36.97 
 
 
165 aa  87  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  46.34 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  50.45 
 
 
144 aa  85.5  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  40.19 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  35.51 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  39.02 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  38.02 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  33.06 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  34.17 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  37.7 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  40.48 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  30.95 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  32.46 
 
 
230 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>