104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0971 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 
139 aa  275  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  85.51 
 
 
140 aa  235  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  81.48 
 
 
140 aa  220  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  78.1 
 
 
140 aa  219  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  82.61 
 
 
140 aa  208  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  73.68 
 
 
142 aa  194  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  69.63 
 
 
140 aa  190  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  69.63 
 
 
140 aa  188  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  69.47 
 
 
139 aa  187  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  71.88 
 
 
133 aa  185  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  66.67 
 
 
151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  70.97 
 
 
135 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  69.53 
 
 
133 aa  181  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  65.93 
 
 
139 aa  179  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  65.89 
 
 
150 aa  174  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  59.71 
 
 
140 aa  174  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  62.31 
 
 
147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  54.89 
 
 
138 aa  147  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  60.83 
 
 
139 aa  147  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  60.48 
 
 
134 aa  145  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  60.48 
 
 
134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  52.21 
 
 
141 aa  140  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  56.9 
 
 
135 aa  136  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  51.18 
 
 
138 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  51.18 
 
 
138 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  52.89 
 
 
129 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  51.18 
 
 
138 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  54.55 
 
 
130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  55.46 
 
 
135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  53.08 
 
 
139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  53.44 
 
 
134 aa  134  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  48.15 
 
 
149 aa  130  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  49.24 
 
 
149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  48.89 
 
 
148 aa  130  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  47.41 
 
 
149 aa  130  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  48.15 
 
 
149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  54.62 
 
 
139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  48.76 
 
 
137 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  53.08 
 
 
139 aa  121  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  50.39 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  42.65 
 
 
143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  46.4 
 
 
147 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  46.27 
 
 
142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  44.09 
 
 
142 aa  115  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  42.97 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  45.97 
 
 
145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  42.54 
 
 
138 aa  113  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  43.51 
 
 
135 aa  111  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  43.88 
 
 
139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  40.3 
 
 
143 aa  110  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  50.41 
 
 
136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  43.75 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  42.74 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  44.03 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  46.22 
 
 
129 aa  107  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  47.86 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  48.72 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  42.4 
 
 
136 aa  104  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  42.97 
 
 
151 aa  104  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  41.18 
 
 
168 aa  103  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  43.07 
 
 
146 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  35.34 
 
 
136 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  44.26 
 
 
141 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  41.67 
 
 
165 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  46.22 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  41.03 
 
 
149 aa  99  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  42.74 
 
 
137 aa  99  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  45 
 
 
139 aa  99.4  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  43.48 
 
 
140 aa  97.1  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  41.54 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  39.42 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  42.62 
 
 
136 aa  93.6  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  38.6 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  41.54 
 
 
141 aa  92.8  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  50.93 
 
 
144 aa  92  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  33.88 
 
 
131 aa  90.9  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  40.91 
 
 
139 aa  90.5  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  36.13 
 
 
131 aa  89.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  42.62 
 
 
134 aa  89  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  42.98 
 
 
133 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  44.8 
 
 
136 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  42.62 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  40.48 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  38.84 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  41.8 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  38.21 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  42.5 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  37.21 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  40.32 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  36 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  32 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  34.38 
 
 
151 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  30.19 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  30.08 
 
 
230 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  34.38 
 
 
122 aa  47.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  29.51 
 
 
119 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  32.17 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  28.93 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>