97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3598 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 140 aa  277  4e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  91.43 
 
 		 140 aa  253  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  64.75 
 
 		 135 aa  166  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  63.16 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  63.2 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  63.93 
 
 		 135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  61.65 
 
 		 136 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  61.07 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  61.48 
 
 		 151 aa  149  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  60.66 
 
 		 136 aa  146  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  57.94 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  59.2 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  52.85 
 
 		 143 aa  141  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  51.91 
 
 		 138 aa  140  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  54.47 
 
 		 143 aa  140  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  54.92 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  57.38 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  55.97 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  53.54 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  54.76 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  54.92 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  54.84 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  57.63 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  51.88 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  55.93 
 
 		 139 aa  123  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  48.31 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  64.6 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  49.15 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  46.61 
 
 		 149 aa  120  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  47.29 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  52.54 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  51.24 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  50.85 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  46.61 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  49.18 
 
 		 133 aa  114  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  49.21 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  47.1 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  50 
 
 		 140 aa  114  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  50.85 
 
 		 140 aa  113  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  49.21 
 
 		 134 aa  113  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  50 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  46.67 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  48.82 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  46.46 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  53.39 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  47.86 
 
 		 139 aa  107  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  50 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  46.72 
 
 		 140 aa  105  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  47.93 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  49.6 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  43.59 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  47.2 
 
 		 168 aa  103  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  46.34 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  41.54 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  47.66 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  41.79 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  44.7 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  42.11 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  43.8 
 
 		 129 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  41.3 
 
 		 138 aa  97.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  43.51 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  45.3 
 
 		 140 aa  97.1  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  44.74 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  41.88 
 
 		 141 aa  94.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  43.9 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  42.64 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  42.64 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  42.64 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  42.74 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  38.52 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  43.41 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  43.36 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  41.88 
 
 		 135 aa  90.5  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  50.82 
 
 		 152 aa  90.1  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  44.36 
 
 		 142 aa  90.1  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  36.29 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  36.89 
 
 		 136 aa  87.8  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  38.02 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  40.98 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  34.75 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  39.17 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  40.32 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  34.45 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  37.4 
 
 		 129 aa  76.6  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  33.85 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  33.63 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  34.65 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  37.61 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  34.35 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  30.89 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  32.54 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  30.97 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  29.31 
 
 		 230 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  29.46 
 
 		 114 aa  43.5  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4122  Roadblock/LC7 family protein  27.59 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>