93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33560 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  263  5.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  45.9 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  44 
 
 		 136 aa  96.7  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  46.67 
 
 		 129 aa  94.4  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  46.77 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  44.72 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  39.84 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  43.9 
 
 		 133 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  42.4 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  41.67 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  43.55 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  40.98 
 
 		 141 aa  86.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  39.84 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  39.02 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  40.8 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  40.8 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  42.4 
 
 		 139 aa  84.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  37.3 
 
 		 143 aa  84.3  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  40.65 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  39.47 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  38.58 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  38.4 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  38.84 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  37.01 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  41.6 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  38.1 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  42.48 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  37.96 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  40.32 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  38.89 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  40.68 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  39.68 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  37.1 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  38.02 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  37.1 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  40.8 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  39.84 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  44.74 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  36.97 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  43.86 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  42.5 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  38.26 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  36.07 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  36.07 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  39.52 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  39.2 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  41.59 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  36.8 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  36.8 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  38.1 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  36.8 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  37.7 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  41.23 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  35.48 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  33.59 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  37.39 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  37.93 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  40.18 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  39.45 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  37.7 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  36 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  37.7 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  32.8 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  39.02 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  39.02 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  38.05 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  38.6 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  36.97 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  38.66 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  41.53 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  34.96 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  36.61 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  36 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  32.26 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  34.82 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  32.23 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  34.17 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  37.19 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  32 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  38.38 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  31.62 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  33.88 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  36 
 
 		 142 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  29.69 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  33.88 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  34.48 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  29.91 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  30.84 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  26.02 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  30.6 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  27.35 
 
 		 131 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4244  dihydroorotase  31.93 
 
 		 419 aa  40.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>