95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2806 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  271  2.0000000000000002e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  81.25 
 
 
134 aa  211  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  76.42 
 
 
168 aa  196  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  71.21 
 
 
139 aa  189  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  70.97 
 
 
138 aa  180  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  63.57 
 
 
141 aa  150  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  50.4 
 
 
136 aa  116  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  46.15 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  48.09 
 
 
142 aa  114  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  50 
 
 
144 aa  113  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  44.36 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  45.24 
 
 
129 aa  110  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  44.19 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  44.53 
 
 
135 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  46.77 
 
 
133 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  43.85 
 
 
143 aa  103  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  45.74 
 
 
139 aa  103  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  46.34 
 
 
140 aa  103  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  43.9 
 
 
135 aa  103  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  47.24 
 
 
146 aa  103  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  46.34 
 
 
151 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  42.86 
 
 
138 aa  102  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  44.44 
 
 
139 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  42.52 
 
 
140 aa  103  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  42.31 
 
 
129 aa  101  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  42.74 
 
 
142 aa  101  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  43.9 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  45.53 
 
 
140 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  42.74 
 
 
139 aa  99  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  43.65 
 
 
139 aa  99  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  42.74 
 
 
140 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  44 
 
 
133 aa  97.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  41.46 
 
 
151 aa  97.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  42.74 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  41.27 
 
 
133 aa  94.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  42.19 
 
 
136 aa  95.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  40 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  39.06 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  41.94 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  41.27 
 
 
133 aa  94.4  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  42.06 
 
 
143 aa  94  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  41.54 
 
 
134 aa  94  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  46.77 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  41.54 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  40.5 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  42.86 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  39.84 
 
 
140 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  38.64 
 
 
149 aa  91.3  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  42.64 
 
 
141 aa  91.3  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  39.67 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  41.88 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  39.39 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  41.88 
 
 
149 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  38.1 
 
 
150 aa  89  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  40.65 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  41.32 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  38.76 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  40.5 
 
 
135 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  38.28 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  40.32 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  34.75 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  44.72 
 
 
140 aa  84.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  39.67 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  35.48 
 
 
136 aa  84  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  37.04 
 
 
150 aa  83.6  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  39.34 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  40.32 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  45.38 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  40.17 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  46.22 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  36.15 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  35.66 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  37.31 
 
 
138 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  36 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  36 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  38.33 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  36 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  34.65 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  37.1 
 
 
145 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  37.1 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  35.2 
 
 
145 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  34.96 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  36.75 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 
151 aa  73.6  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  35.48 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  36.72 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  33.62 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  35.29 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  40.32 
 
 
136 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  30.89 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  30.08 
 
 
165 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  32.48 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  29.17 
 
 
230 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7109  Fe-S oxidoreductase  31.71 
 
 
703 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345593  normal  0.70276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>