92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3691 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 
131 aa  260  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  71.88 
 
 
136 aa  184  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  76.11 
 
 
137 aa  165  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  65.08 
 
 
131 aa  153  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  56.2 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  60.16 
 
 
145 aa  127  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  49.17 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  49.58 
 
 
135 aa  114  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  47.58 
 
 
134 aa  114  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  48.74 
 
 
135 aa  113  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  47.9 
 
 
140 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  49.58 
 
 
134 aa  113  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  47.9 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  45.45 
 
 
139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  47.06 
 
 
150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  44.54 
 
 
142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  44.63 
 
 
139 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  43.8 
 
 
140 aa  104  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  42.15 
 
 
151 aa  102  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  41.46 
 
 
133 aa  100  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  39.2 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  42.28 
 
 
133 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  39.68 
 
 
135 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  41.88 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  39.5 
 
 
140 aa  97.1  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  41.18 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  41.03 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  39.5 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  40.34 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  40.34 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  40.34 
 
 
138 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  40.32 
 
 
129 aa  94  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  41.18 
 
 
130 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  41.46 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  41.03 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  39.34 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  40.17 
 
 
149 aa  90.9  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  40.52 
 
 
148 aa  91.3  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  40.48 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  36.13 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  38.4 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  40.32 
 
 
139 aa  88.6  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  36.97 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  37.9 
 
 
143 aa  87  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  37.9 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  37.7 
 
 
142 aa  83.6  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  38.66 
 
 
138 aa  83.6  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  35.25 
 
 
129 aa  83.6  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  34.11 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  33.87 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  35.48 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  36.29 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  34.68 
 
 
135 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  34.92 
 
 
142 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  37.7 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  41.53 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  35.29 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  34.45 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  36.97 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  43.48 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  33.61 
 
 
143 aa  77  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  33.61 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  36.29 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  32.79 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  34.13 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  36.36 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  36.21 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  35.48 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  32.8 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  41.6 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  34.62 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  31.2 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  31.09 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  31.4 
 
 
141 aa  67  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  38.1 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  31.09 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  30.08 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  30.23 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  36.36 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  31.93 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  32.81 
 
 
134 aa  62.8  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  30.16 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  31.67 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  30.33 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  35.2 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  28.95 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  30.43 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  29.84 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  31.4 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  27.35 
 
 
131 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  25.93 
 
 
151 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>