99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0361 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  270  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  88.64 
 
 
135 aa  238  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  65.93 
 
 
139 aa  177  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  68.55 
 
 
142 aa  177  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  68.29 
 
 
129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  63.36 
 
 
139 aa  166  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  61.83 
 
 
136 aa  166  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  64.8 
 
 
136 aa  164  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  62.6 
 
 
151 aa  161  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  64.23 
 
 
140 aa  161  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  63.93 
 
 
140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  60.47 
 
 
140 aa  159  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  54.81 
 
 
143 aa  158  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  54.07 
 
 
143 aa  156  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  60.98 
 
 
133 aa  153  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  56.91 
 
 
149 aa  150  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  57.38 
 
 
146 aa  147  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  52.27 
 
 
138 aa  143  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  54.76 
 
 
139 aa  140  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  52.71 
 
 
150 aa  140  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  55.38 
 
 
142 aa  140  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  65.18 
 
 
144 aa  138  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  53.85 
 
 
141 aa  138  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  59.66 
 
 
139 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  51.64 
 
 
139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  47.93 
 
 
139 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  57.98 
 
 
139 aa  120  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  48.48 
 
 
143 aa  118  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  45.24 
 
 
151 aa  118  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  48.09 
 
 
142 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  44 
 
 
133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  45.67 
 
 
134 aa  117  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  45.67 
 
 
134 aa  116  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  44.35 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  52.85 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  44.26 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  48.46 
 
 
139 aa  114  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  48.03 
 
 
144 aa  111  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  44.54 
 
 
135 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  41.79 
 
 
140 aa  110  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  44.96 
 
 
168 aa  110  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  51.26 
 
 
136 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  41.43 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  43.75 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  45.45 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  41.43 
 
 
140 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  43.8 
 
 
148 aa  107  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  41.09 
 
 
150 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  42.98 
 
 
149 aa  106  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  43.41 
 
 
139 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  40.68 
 
 
140 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  43.1 
 
 
147 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  42.15 
 
 
149 aa  105  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  39.68 
 
 
135 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  39.68 
 
 
135 aa  104  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  44 
 
 
134 aa  103  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  43.9 
 
 
137 aa  103  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  40.46 
 
 
130 aa  103  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  44.8 
 
 
140 aa  102  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  39.37 
 
 
149 aa  101  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  40.62 
 
 
138 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  40.62 
 
 
138 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  40.62 
 
 
138 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  42.74 
 
 
140 aa  97.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  39.67 
 
 
138 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  41.8 
 
 
129 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  40.62 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  40.32 
 
 
137 aa  94  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  38.1 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  38.14 
 
 
141 aa  90.5  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  36.92 
 
 
139 aa  90.1  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  43.2 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  37.9 
 
 
134 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  38.21 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  32.79 
 
 
165 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  35.43 
 
 
131 aa  84  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  34.07 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  38.21 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  33.6 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  37.01 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  34.68 
 
 
131 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  35.77 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  34.59 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  36.51 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  32.8 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  33.6 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  33.07 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  33.93 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  33.61 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  30.63 
 
 
137 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  29.92 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  26.98 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  28.81 
 
 
230 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  25.64 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  29.06 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  30.39 
 
 
148 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  27.73 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>