104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02260 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  273  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  75.61 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  68.99 
 
 		 140 aa  180  7e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  66.4 
 
 		 151 aa  172  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  61.65 
 
 		 135 aa  168  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  59.69 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  61.83 
 
 		 135 aa  166  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  59.2 
 
 		 138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  70.94 
 
 		 144 aa  153  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  60.66 
 
 		 140 aa  146  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  60.98 
 
 		 136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  57.26 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  54.26 
 
 		 143 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  51.16 
 
 		 143 aa  142  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  55.81 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  59.84 
 
 		 139 aa  143  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  59.84 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  59.35 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  54.92 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  51.13 
 
 		 141 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  51.16 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  51.2 
 
 		 133 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  47.97 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  50 
 
 		 150 aa  117  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  42.64 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  54.33 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  47.11 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  42.75 
 
 		 168 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  45.45 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  49.59 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  47.11 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  42.97 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  43.9 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  48.78 
 
 		 139 aa  104  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  42.4 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  44 
 
 		 135 aa  104  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  41.13 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  42.11 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  42.06 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  39.84 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  41.74 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  39.52 
 
 		 133 aa  100  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  43.09 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  40.94 
 
 		 137 aa  100  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  42.28 
 
 		 150 aa  100  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  44.35 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  40.87 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  40.68 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  41.09 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  41.74 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  41.35 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  39.39 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  40.31 
 
 		 140 aa  95.9  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  39.2 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  42.19 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  37.98 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  38.89 
 
 		 135 aa  94.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  40 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  38.89 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  38.58 
 
 		 141 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  40.48 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  44.35 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  36.59 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  39.67 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  39.67 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  39.67 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  39.02 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  42.74 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  43.44 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  34.53 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  36.36 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  37.5 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  38.02 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  36.29 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  35.16 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  37.19 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  34.4 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  40.46 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  36.43 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  35.16 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  36.97 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  35.71 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  31.25 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  32.79 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  31.2 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  30.33 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  30.08 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  31.45 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  31.78 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  32.52 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  29.41 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  26.55 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  30.33 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  30.28 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  26.89 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  30.7 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  30.7 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  24.79 
 
 		 277 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  30.17 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  29.82 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>