54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1016 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 
114 aa  223  7e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  94.74 
 
 
114 aa  212  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  93.86 
 
 
114 aa  209  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  93.86 
 
 
114 aa  209  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  82.46 
 
 
114 aa  194  5.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  42.34 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  42.34 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  38.74 
 
 
115 aa  87.4  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  41.07 
 
 
120 aa  86.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  38.74 
 
 
115 aa  83.6  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  41.07 
 
 
120 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  38.39 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  36.52 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  36.52 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  37.5 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  38 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  39.25 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  39.25 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  35 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  36 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  34.23 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  34.26 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 
119 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  36 
 
 
122 aa  67.4  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  33.98 
 
 
119 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  33.01 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  34.44 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1376  Roadblock/LC7 family protein  35.34 
 
 
117 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0196587 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1029  roadblock/LC7 family protein  29.25 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1151  Roadblock/LC7 family protein  34.45 
 
 
117 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.210812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  26.79 
 
 
277 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  29.9 
 
 
130 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  29.46 
 
 
125 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1132  Roadblock/LC7 family protein  31.13 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2155  Roadblock/LC7 family protein  30 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  29.25 
 
 
143 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0830  roadblock/LC7 domain-contain protein  27.93 
 
 
224 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0276652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3233  roadblock/LC7 family protein  28.87 
 
 
123 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.589466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0933  roadblock/LC7 family protein  31.53 
 
 
121 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0781277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3343  roadblock/LC7 family protein  30.97 
 
 
263 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0401  roadblock/LC7 domain protein  33.75 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  30.17 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  30.36 
 
 
142 aa  42.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  31.07 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0565  Roadblock/LC7 family protein  33.75 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0216  roadblock/LC7 family protein  30.49 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  28.3 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2475  hypothetical protein  28.07 
 
 
258 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3142  roadblock/LC7 family protein  28.32 
 
 
265 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1006  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
188 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  24.49 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  33.04 
 
 
151 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1067  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
188 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  32.14 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>