82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0746 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 122 aa  238  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  97.54 
 
 		 122 aa  232  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  89.34 
 
 		 122 aa  219  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  85.25 
 
 		 122 aa  207  4e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  57.14 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  51.26 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  56.52 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  55.65 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  56.19 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  56.76 
 
 		 120 aa  120  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  56.76 
 
 		 120 aa  120  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  54.29 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  51.72 
 
 		 230 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  50.91 
 
 		 277 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  51.04 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  51.04 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1029  roadblock/LC7 family protein  43.24 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  41.35 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  32.76 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  38 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  36.27 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0565  Roadblock/LC7 family protein  39.56 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  33.63 
 
 		 114 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3233  roadblock/LC7 family protein  31.71 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.589466 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0401  roadblock/LC7 domain protein  39.76 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  29.37 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  38.3 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2217  roadblock/LC7 domain-contain protein  32.14 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129735  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  34.51 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7712  hypothetical protein  33.64 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  36.17 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  37.08 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  34.74 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  34.74 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  33.71 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  35.87 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1348  roadblock/LC7 family protein  26.92 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  35.23 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  31.91 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  30.93 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  24.75 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  26.26 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  34.38 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1137  roadblock/LC7 family protein  25 
 
 		 293 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634686  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  29.82 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  32.98 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4122  Roadblock/LC7 family protein  35.23 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  32.98 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  22.22 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  32.29 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  31.18 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  32.63 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  31.91 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  32.18 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  34.88 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  30.53 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  32.98 
 
 		 147 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  31.18 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  30.11 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  30.85 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  29.63 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  33.72 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  35.11 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  29.79 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  31.11 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  27.52 
 
 		 115 aa  43.5  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  29.03 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  26.27 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  29.47 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  27.52 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0254  roadblock/LC7 family protein  26.09 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  25.93 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  30.77 
 
 		 138 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  30.77 
 
 		 138 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  30.77 
 
 		 138 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  26.85 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  29.89 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  32.26 
 
 		 136 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  26.44 
 
 		 143 aa  40  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>