52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1006 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 115 aa  224  4e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  72.17 
 
 		 115 aa  174  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  36.84 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0933  roadblock/LC7 family protein  37.72 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0781277  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  35.65 
 
 		 114 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  35.65 
 
 		 114 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  36.52 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  34.78 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  33.91 
 
 		 114 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1151  Roadblock/LC7 family protein  36.21 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.210812 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1376  Roadblock/LC7 family protein  34.48 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0196587 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1132  Roadblock/LC7 family protein  35.85 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  28.18 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  29.52 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  28.97 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  29.73 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3343  roadblock/LC7 family protein  34.23 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  29.73 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2475  hypothetical protein  32.69 
 
 		 258 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  30.48 
 
 		 230 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  29.55 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3142  roadblock/LC7 family protein  33.01 
 
 		 265 aa  51.2  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  25 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  29.09 
 
 		 120 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  29.09 
 
 		 120 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  24.07 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  26.67 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  27.83 
 
 		 120 aa  47.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  22.22 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  27.83 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  18.75 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  29.52 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0108  roadblock/LC7 family protein  35.14 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0102077 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  27.27 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  28.42 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  27.45 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  29.67 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  22.43 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  26.47 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  18.58 
 
 		 122 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1020  hypothetical protein  35.42 
 
 		 99 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0409339  hitchhiker  0.000000330929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  26.47 
 
 		 140 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3233  roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.589466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  25.49 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  30 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2355  hypothetical protein  23.36 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387117  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  27.62 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  27.17 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  28.97 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  23.71 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0557  hypothetical protein  27.37 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  22.58 
 
 		 136 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>