69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4464 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 
122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  86.07 
 
 
122 aa  208  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  85.25 
 
 
122 aa  207  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  84.43 
 
 
122 aa  203  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  58.82 
 
 
120 aa  133  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  52.94 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  55.46 
 
 
120 aa  123  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  55.46 
 
 
120 aa  121  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  55.93 
 
 
120 aa  120  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  55.93 
 
 
120 aa  120  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  52.38 
 
 
119 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  50.48 
 
 
122 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  45.83 
 
 
230 aa  103  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1029  roadblock/LC7 family protein  44.14 
 
 
114 aa  96.3  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  45.69 
 
 
277 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  48.98 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  48.98 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  40.54 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  35 
 
 
114 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  30.08 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  36 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  34.65 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  34.65 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  33.66 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0565  Roadblock/LC7 family protein  37.36 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3233  roadblock/LC7 family protein  28.46 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.589466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  26.02 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7712  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0401  roadblock/LC7 domain protein  37.35 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  35.11 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  35.42 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  35.11 
 
 
139 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2217  roadblock/LC7 domain-contain protein  30.36 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129735  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  31.86 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4122  Roadblock/LC7 family protein  30.36 
 
 
131 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881937  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  27.43 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  31.46 
 
 
138 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  31.25 
 
 
140 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  31.58 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  27.83 
 
 
139 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  29.17 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  35.96 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  29.2 
 
 
121 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  31.18 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  30.53 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  31.18 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  27.66 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  22.43 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1348  roadblock/LC7 family protein  26.88 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  31.68 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  30.21 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  27.62 
 
 
147 aa  42  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  29.03 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  28.83 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1137  roadblock/LC7 family protein  21.62 
 
 
293 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634686  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  32.63 
 
 
150 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  27.17 
 
 
115 aa  41.6  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0701  roadblock/LC7 family protein  31.11 
 
 
118 aa  41.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.716887  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  28.72 
 
 
140 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  28.72 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  29.47 
 
 
147 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  27.12 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0294  roadblock/LC7 family protein  28.16 
 
 
126 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0254  roadblock/LC7 family protein  26 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0308  roadblock/LC7 family protein  29 
 
 
120 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  28.42 
 
 
148 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  29.03 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  24.49 
 
 
148 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  27.17 
 
 
139 aa  40  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>