65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0078 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 119 aa  231  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  99.15 
 
 		 119 aa  228  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  52.08 
 
 		 122 aa  103  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  51.04 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  51.04 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  46.79 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  45.05 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  51.02 
 
 		 120 aa  97.1  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  53.85 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  48.98 
 
 		 122 aa  94.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  46.94 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  45.92 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  46.3 
 
 		 230 aa  90.5  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  51.65 
 
 		 120 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  51.65 
 
 		 120 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1029  roadblock/LC7 family protein  41.96 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  38.18 
 
 		 277 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  39.8 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  36.04 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  34.26 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  31.48 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  30.56 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  30.56 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0254  roadblock/LC7 family protein  29.82 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  33.64 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0701  roadblock/LC7 family protein  39 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.716887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0565  Roadblock/LC7 family protein  38.2 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0401  roadblock/LC7 domain protein  38.89 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4311  Roadblock/LC7 family protein  35.29 
 
 		 426 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  29.36 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  31.82 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  24.77 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3233  roadblock/LC7 family protein  28.83 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.589466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  30.17 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  30.17 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  27.27 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  25 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  27.97 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  30.97 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  30.3 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  31.09 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4094  Roadblock/LC7 family protein  31 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1005  roadblock/LC7 family protein  32.04 
 
 		 223 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0861653  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  26.17 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0695  hypothetical protein  30.21 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  25.42 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  27.12 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7712  hypothetical protein  37.86 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  30.28 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  30.56 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1137  roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 		 293 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634686  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  28.93 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  27.97 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  32.71 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  25.93 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  25.62 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  28.57 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  26.45 
 
 		 149 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  27.18 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2475  hypothetical protein  29.57 
 
 		 258 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0108  roadblock/LC7 family protein  28.81 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0102077 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1132  Roadblock/LC7 family protein  32.69 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  27.52 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  31.07 
 
 		 121 aa  40.4  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  26.27 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>