63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0658 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 120 aa  236  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  97.5 
 
 		 120 aa  229  7.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  67.5 
 
 		 120 aa  170  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  66.67 
 
 		 120 aa  167  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  68.33 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  68.33 
 
 		 120 aa  165  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  53.78 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  55.65 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  55.46 
 
 		 122 aa  123  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  54.78 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  46.09 
 
 		 119 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  46.96 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  45.38 
 
 		 230 aa  101  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  42.02 
 
 		 277 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  46.94 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  46.94 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0565  Roadblock/LC7 family protein  49.47 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1029  roadblock/LC7 family protein  41.07 
 
 		 114 aa  90.9  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0401  roadblock/LC7 domain protein  50 
 
 		 136 aa  87.8  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  40.18 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  37.61 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  38.39 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  37.5 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  37.5 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  37.5 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  27.87 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2217  roadblock/LC7 domain-contain protein  32.74 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.129735  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  29.17 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3233  roadblock/LC7 family protein  27.5 
 
 		 123 aa  57  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.589466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  32.65 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2681  Roadblock/LC7 family protein  35.87 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000022106 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  32.65 
 
 		 115 aa  51.2  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  31.78 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  31.62 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4094  Roadblock/LC7 family protein  28.81 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  30.77 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  30.61 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  30.61 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1137  roadblock/LC7 family protein  20 
 
 		 293 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  31.62 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0254  roadblock/LC7 family protein  31.63 
 
 		 125 aa  47.4  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  27.83 
 
 		 115 aa  47.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7712  hypothetical protein  33.66 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  30.69 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  32.67 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0701  roadblock/LC7 family protein  31.07 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.716887  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  30.1 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  25.77 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  29.06 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  29.81 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  28.85 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  26.09 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1151  Roadblock/LC7 family protein  26.96 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.210812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  31.68 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  31.68 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  30.19 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0933  roadblock/LC7 family protein  29.41 
 
 		 121 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0781277  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  29.91 
 
 		 151 aa  41.6  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  24.37 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2155  Roadblock/LC7 family protein  24.14 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  29.7 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  29.81 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  29.07 
 
 		 139 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>