34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4223 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 115 aa  217  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  81.74 
 
 		 115 aa  186  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  80 
 
 		 119 aa  185  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  80 
 
 		 119 aa  185  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  40.54 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  40.54 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  39.64 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  40 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  38.74 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  33.64 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  29.52 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  28.95 
 
 		 115 aa  57  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  34.38 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  29.9 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  32.65 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  32.65 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  34.38 
 
 		 120 aa  50.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  34.38 
 
 		 120 aa  50.8  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  31.82 
 
 		 119 aa  50.4  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1488  roadblock/LC7 domain-contain protein  33.96 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000487371  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  30.91 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3233  roadblock/LC7 family protein  35.64 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.589466 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  29.36 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1132  Roadblock/LC7 family protein  27.35 
 
 		 118 aa  47  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  27.43 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0830  roadblock/LC7 domain-contain protein  29.52 
 
 		 224 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0276652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  28.95 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  31.91 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  27.52 
 
 		 122 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2155  Roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  30.48 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  31 
 
 		 277 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7712  hypothetical protein  32.35 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>