63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0274 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 148 aa  296  9e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4122  Roadblock/LC7 family protein  39.34 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1599  Roadblock/LC7 family protein  46.85 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.25658 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  36.13 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  34.4 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3041  Roadblock/LC7 family protein  38.04 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7712  hypothetical protein  31.62 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01150  hypothetical protein  36.96 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  27.93 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  30.43 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  29.31 
 
 		 230 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  27.2 
 
 		 148 aa  50.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  27.72 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  30.63 
 
 		 115 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0254  roadblock/LC7 family protein  32.35 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  34 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  27.78 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  27.97 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  25.42 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  35.78 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  31.86 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  36.17 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  30.77 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  28.28 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  30.95 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  26.67 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  28.74 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  34.91 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  30.63 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  25.83 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  30.63 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  31 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  27.12 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  27.27 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  30.95 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  25 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  23.73 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0367  roadblock/LC7 family protein  27.83 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  32.11 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  30.77 
 
 		 141 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  23.73 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  23.73 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  31.86 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  28.71 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  28.41 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  23.68 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  30 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  23.89 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4223  roadblock/LC7 family protein  30.48 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  24.78 
 
 		 114 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  27.97 
 
 		 138 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  27.66 
 
 		 151 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  24.78 
 
 		 114 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  25.22 
 
 		 122 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  27.97 
 
 		 138 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  27.97 
 
 		 138 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  30.19 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  28.83 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  29.75 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  25.42 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  25.98 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  26.42 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>