29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1599 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1599  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 125 aa  238  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.25658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4122  Roadblock/LC7 family protein  50 
 
 		 131 aa  97.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  44.76 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  29.6 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  34.38 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0957  roadblock/LC7 family protein  30 
 
 		 114 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  34.69 
 
 		 277 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  37.66 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7712  hypothetical protein  29.91 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  32.23 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  31.86 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  36.36 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  29.59 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  32.99 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1016  roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  31.86 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  29.59 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  33.08 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  35.24 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  28.57 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0695  roadblock/LC7 family protein  28.43 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  35.24 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3041  Roadblock/LC7 family protein  31.13 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2578  roadblock/LC7 domain protein  32.58 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2208  Roadblock/LC7 family protein  32.58 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.518676  normal  0.172353 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  32.56 
 
 		 120 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  31.03 
 
 		 141 aa  40  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  28.26 
 
 		 122 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>