34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4122 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4122  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 131 aa  249  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1599  Roadblock/LC7 family protein  50 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.25658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  37.27 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  31.58 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  27.19 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  31.31 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  35.23 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  30.36 
 
 		 122 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  32.71 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  30.84 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  26.56 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  30.3 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  24.77 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  32.95 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  30.77 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01150  hypothetical protein  29.9 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  28.57 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  28.07 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  26.83 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6136  hypothetical protein  31.9 
 
 		 277 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160377 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  26.19 
 
 		 137 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  32.2 
 
 		 133 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  28.04 
 
 		 150 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  28.71 
 
 		 135 aa  42  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  27.59 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  32.46 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  28.12 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  27.68 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  30.56 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  26.61 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  29.66 
 
 		 129 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  29.63 
 
 		 139 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  27.1 
 
 		 139 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>