115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37480 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  279  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  69.35 
 
 		 142 aa  181  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  62.12 
 
 		 140 aa  176  9e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  62.99 
 
 		 151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  58.02 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  59.2 
 
 		 136 aa  154  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  52.99 
 
 		 143 aa  153  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  54.55 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  49.26 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  55.3 
 
 		 136 aa  144  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  52.27 
 
 		 135 aa  143  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  51.82 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  51.91 
 
 		 140 aa  140  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  49.24 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  49.62 
 
 		 140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  52.46 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  48.48 
 
 		 142 aa  131  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  63.16 
 
 		 144 aa  130  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  50.38 
 
 		 139 aa  129  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  49.19 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  51.97 
 
 		 139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  48.06 
 
 		 133 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  47.1 
 
 		 142 aa  125  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  46.62 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  46.27 
 
 		 140 aa  124  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  50.79 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  46.27 
 
 		 140 aa  123  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  49.21 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  47.58 
 
 		 139 aa  120  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  44.03 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  42.75 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  46.15 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  47.73 
 
 		 168 aa  116  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  48.78 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  46.92 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  48.03 
 
 		 135 aa  115  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  45.8 
 
 		 150 aa  114  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  42.54 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  42.54 
 
 		 139 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  42.64 
 
 		 133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  42.97 
 
 		 133 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  47.24 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  46.22 
 
 		 150 aa  110  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  44.78 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  44.62 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  45.74 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  41.61 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  43.08 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  44.62 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  45.3 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  42.86 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  43.8 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  45.3 
 
 		 148 aa  103  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  43.59 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  36.15 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  42.98 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  42.11 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  42.11 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  42.11 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  40.44 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  40.46 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  42.74 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  36.84 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  43.08 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  39.52 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  39.34 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  41.79 
 
 		 137 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  40.65 
 
 		 134 aa  95.9  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  41.46 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  44.62 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  36.15 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  42.34 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  38.21 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  44 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  36.72 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  40.8 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  34.56 
 
 		 147 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  38.4 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  37.1 
 
 		 134 aa  87.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  35.88 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  31.5 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  36.29 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  34.51 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  35.77 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  37.1 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  35.38 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  33.09 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  36.13 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  34.11 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  31.62 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  30.58 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  29.55 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  34.71 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  32.8 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  31.73 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  33.71 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  31.62 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  28.43 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  31.36 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  32.58 
 
 		 122 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>