104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01810 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  297  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  92.62 
 
 		 149 aa  279  8.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  87.16 
 
 		 149 aa  263  4e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  85.92 
 
 		 149 aa  254  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  70.14 
 
 		 148 aa  214  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  53.24 
 
 		 140 aa  163  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  58.09 
 
 		 142 aa  160  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  53.24 
 
 		 140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  58.4 
 
 		 139 aa  150  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  57.26 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  57.26 
 
 		 134 aa  143  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  50.38 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  50.79 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  48.2 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  48.91 
 
 		 140 aa  137  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  49.29 
 
 		 140 aa  136  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  48.12 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  55.46 
 
 		 135 aa  134  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  51.88 
 
 		 135 aa  133  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  47.01 
 
 		 140 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  44.9 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  48.51 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  48.51 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  48.51 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  47.41 
 
 		 139 aa  130  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  50 
 
 		 141 aa  130  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  50.41 
 
 		 143 aa  130  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  54.55 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  50 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  48.31 
 
 		 140 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  51.91 
 
 		 139 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  48 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  51.15 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  44.62 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  45.86 
 
 		 149 aa  124  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  42.75 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  44.6 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  45.26 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  46.61 
 
 		 140 aa  120  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  43.8 
 
 		 142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  43.48 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  50 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  45.6 
 
 		 133 aa  118  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  45.31 
 
 		 134 aa  115  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  47.46 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  40.3 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  48.62 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  45.13 
 
 		 136 aa  110  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  42.75 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  40.94 
 
 		 139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  41.32 
 
 		 142 aa  107  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  43.44 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  45.53 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  42.15 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  43.18 
 
 		 142 aa  104  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  37.8 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  45.38 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  46.1 
 
 		 152 aa  103  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  41.13 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  45.24 
 
 		 139 aa  103  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  43.59 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  40 
 
 		 136 aa  100  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  40.71 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  41.74 
 
 		 136 aa  100  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  42.5 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  35.62 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  41.88 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  40.18 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  39.83 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  36.36 
 
 		 150 aa  95.5  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  39.17 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  39.29 
 
 		 168 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  35.66 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  42.34 
 
 		 137 aa  93.6  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  41.67 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  39.68 
 
 		 138 aa  92.8  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  38.64 
 
 		 137 aa  91.3  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  41.27 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  41.54 
 
 		 145 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  33.81 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  40.17 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  39.2 
 
 		 141 aa  86.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  42.61 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  39.01 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  37.8 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  38.4 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  37.96 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  32.43 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  40.57 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  36.89 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  32.54 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  33.61 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  26.77 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  32.77 
 
 		 230 aa  60.8  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  31.18 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  29.41 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  31.3 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  31.18 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  27.27 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  31.18 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>