92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0738 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 
140 aa  276  7e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  43.48 
 
 
139 aa  97.1  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  39.13 
 
 
140 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  41.12 
 
 
140 aa  92  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  37.7 
 
 
142 aa  91.3  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  43.81 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  42.86 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  35.38 
 
 
140 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  44.33 
 
 
140 aa  90.1  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  35.38 
 
 
140 aa  89  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  45.71 
 
 
130 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  38.21 
 
 
135 aa  87  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  39.62 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  39.53 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  41.51 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  39.45 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  45.28 
 
 
129 aa  84.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  38.79 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  40.95 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  38.33 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  39.47 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  44.34 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  40.98 
 
 
134 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  44.34 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  44.34 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  40.19 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  40.19 
 
 
134 aa  80.1  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  38.79 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  33.85 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  35.4 
 
 
140 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  39.81 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  36.21 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  33.9 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  34.21 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  34.21 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  37.6 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  29.55 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  33.93 
 
 
135 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  32.79 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  31.78 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  37.39 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  31.4 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  32.54 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  35.24 
 
 
136 aa  67  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  32.54 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  33.93 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  31.01 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  35.9 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  35.59 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  32.31 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  31.65 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  32.26 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  33.63 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  28.83 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  35.34 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  33.63 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  33.96 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  35.29 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  32.52 
 
 
136 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  29.17 
 
 
146 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  31.09 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  30.97 
 
 
140 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  28.24 
 
 
141 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  34.75 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  31.06 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  32.48 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  28.33 
 
 
140 aa  58.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  33.63 
 
 
141 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  31.71 
 
 
139 aa  57.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  29.23 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  27.59 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  30.56 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  33.05 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  29.75 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  33.02 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  30.36 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  29.46 
 
 
129 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  28.95 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  32.23 
 
 
134 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  31.86 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  35.59 
 
 
152 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  29.17 
 
 
165 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  26.89 
 
 
136 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  34.41 
 
 
150 aa  50.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  33.05 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  30.17 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  33.71 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  30.25 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  29.57 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  31.71 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  31.67 
 
 
230 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>