97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13400 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  256  6e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  82.11 
 
 
129 aa  199  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  81.82 
 
 
138 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  81.82 
 
 
138 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  81.82 
 
 
138 aa  195  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  74.4 
 
 
137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  61.16 
 
 
139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  64.6 
 
 
134 aa  148  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  64.6 
 
 
134 aa  147  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  58.68 
 
 
142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  56.8 
 
 
133 aa  144  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  61.26 
 
 
135 aa  143  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  60.36 
 
 
135 aa  142  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  61.26 
 
 
139 aa  141  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  52.89 
 
 
140 aa  140  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  55.37 
 
 
140 aa  140  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  58.2 
 
 
139 aa  140  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  55.37 
 
 
140 aa  140  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  54.55 
 
 
140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  61.26 
 
 
147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  56.2 
 
 
135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  61.95 
 
 
140 aa  137  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  62.16 
 
 
151 aa  137  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  57.02 
 
 
139 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  58.77 
 
 
150 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  54.55 
 
 
139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  51.91 
 
 
138 aa  133  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  52.85 
 
 
133 aa  133  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  52.89 
 
 
140 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  54.55 
 
 
149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  57.02 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  50 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  52.73 
 
 
149 aa  124  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  52.38 
 
 
134 aa  124  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  54.55 
 
 
149 aa  123  9e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  50.91 
 
 
149 aa  116  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  44.63 
 
 
146 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  43.31 
 
 
141 aa  107  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  47.79 
 
 
135 aa  105  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  44.25 
 
 
143 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  44.7 
 
 
145 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  50.43 
 
 
139 aa  103  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  44.25 
 
 
136 aa  103  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  40.46 
 
 
135 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  40.94 
 
 
147 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  50.43 
 
 
139 aa  100  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  47.79 
 
 
129 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  48.06 
 
 
145 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  46.02 
 
 
139 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  43.97 
 
 
141 aa  99.4  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  42.98 
 
 
151 aa  98.6  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  42.15 
 
 
140 aa  99  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  47.12 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  43.9 
 
 
139 aa  98.2  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  45.16 
 
 
136 aa  97.8  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  40.48 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  41.59 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  39.67 
 
 
131 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  41.46 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  40.8 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  39.84 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  41.18 
 
 
131 aa  93.6  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  38.84 
 
 
143 aa  93.2  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  43.36 
 
 
140 aa  92.8  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  41.74 
 
 
136 aa  93.2  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  39.02 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  43.36 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  45.16 
 
 
130 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  45.71 
 
 
140 aa  88.2  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  39.66 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  42.28 
 
 
168 aa  87  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  37.59 
 
 
141 aa  85.1  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  43.36 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  38.05 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  36.75 
 
 
165 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  44.44 
 
 
152 aa  84  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  39.32 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  39.02 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  38.98 
 
 
138 aa  82  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  40.18 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  40.17 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  45.38 
 
 
136 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  41.07 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  39.5 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  43.48 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  40.91 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  38.26 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  34.96 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  36.61 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  31.5 
 
 
151 aa  60.8  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  32.77 
 
 
230 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  31.34 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  32.98 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  31.91 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  32.98 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>