102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5171 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 147 aa  293  7e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  66.91 
 
 		 150 aa  189  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  63.7 
 
 		 139 aa  184  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  65.89 
 
 		 139 aa  183  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  60.74 
 
 		 151 aa  177  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  62.31 
 
 		 139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  59.26 
 
 		 140 aa  170  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  66.39 
 
 		 134 aa  165  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  61.54 
 
 		 133 aa  165  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  66.39 
 
 		 134 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  58.91 
 
 		 140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  61.79 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  61.29 
 
 		 135 aa  161  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  58.33 
 
 		 139 aa  160  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  57.81 
 
 		 142 aa  159  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  61.29 
 
 		 133 aa  159  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  57.36 
 
 		 140 aa  159  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  55.04 
 
 		 140 aa  156  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  54.26 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  65.32 
 
 		 140 aa  150  8e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  57.36 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  58.14 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  53.12 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  53.12 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  53.12 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  61.26 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  53.66 
 
 		 129 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  54.47 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  51.22 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  46.67 
 
 		 139 aa  126  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  46.51 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  46.97 
 
 		 139 aa  125  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  42.75 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  44.19 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  45.8 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  50.82 
 
 		 134 aa  120  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  43.41 
 
 		 149 aa  120  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  46.4 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  45.24 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  43.9 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  44.06 
 
 		 147 aa  113  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  42.52 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  44.03 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  42.64 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  42.19 
 
 		 135 aa  110  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  41.22 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  43.41 
 
 		 136 aa  107  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  43.1 
 
 		 135 aa  105  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  40.77 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  42.5 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  37.6 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  40.98 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  45.04 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  42.54 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  39.84 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  41.79 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  39.2 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  40.14 
 
 		 145 aa  98.6  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  39.52 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  44 
 
 		 138 aa  97.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  42.11 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  42.28 
 
 		 139 aa  97.4  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  40.31 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  39.53 
 
 		 142 aa  97.1  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  41.88 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  42.74 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  39.06 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  42.52 
 
 		 168 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  43.97 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  45.53 
 
 		 139 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  43.31 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  43.31 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  38.33 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  38.58 
 
 		 141 aa  88.6  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  47.83 
 
 		 144 aa  87.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  36.36 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  38.52 
 
 		 136 aa  87  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  33.59 
 
 		 165 aa  84.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  38.79 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  41.41 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  35.51 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  38.58 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  36.22 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  38.52 
 
 		 130 aa  76.6  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  36.72 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  37.4 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  38.66 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  37.7 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  28.95 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  37.39 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  29.6 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  29.03 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  30.33 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  32.98 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  30.51 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  27.62 
 
 		 122 aa  42  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0380  roadblock/LC7 family protein  26.77 
 
 		 125 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  26.89 
 
 		 119 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0078  Roadblock/LC7 family protein  26.27 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.160642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>