107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2385 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 139 aa  278  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  94.96 
 
 		 139 aa  239  9e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  62.12 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  58.33 
 
 		 140 aa  163  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  59.09 
 
 		 140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  58.73 
 
 		 139 aa  157  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  56.92 
 
 		 151 aa  155  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  57.14 
 
 		 139 aa  153  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  59.66 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  57.14 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  57.38 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  58.4 
 
 		 139 aa  150  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  53.85 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  59.5 
 
 		 139 aa  147  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  53.44 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  52.94 
 
 		 136 aa  146  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  61.54 
 
 		 136 aa  146  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  54.26 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  52.31 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  51.91 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  51.52 
 
 		 140 aa  144  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  57.63 
 
 		 140 aa  143  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  54.84 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  51.91 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  51.15 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  53.08 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  54.62 
 
 		 139 aa  141  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  53.85 
 
 		 150 aa  140  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  54.92 
 
 		 133 aa  140  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  46.67 
 
 		 147 aa  140  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  56.1 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  51.59 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  53.6 
 
 		 133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  48.82 
 
 		 143 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  49.62 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  52.8 
 
 		 134 aa  137  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  47.66 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  52.8 
 
 		 134 aa  137  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  51.54 
 
 		 140 aa  136  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  54.47 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  51.59 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  52.27 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  50 
 
 		 141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  52.38 
 
 		 142 aa  130  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  48.82 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  49.19 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  51.15 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  50.77 
 
 		 133 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  48.44 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  45.8 
 
 		 141 aa  124  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  44.27 
 
 		 138 aa  124  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  46.88 
 
 		 135 aa  124  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  48.33 
 
 		 135 aa  123  7e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  48.82 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  45.86 
 
 		 150 aa  120  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  47.66 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  47.66 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  47.66 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  49.18 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  46.51 
 
 		 137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  40 
 
 		 141 aa  116  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  63.11 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  45.9 
 
 		 139 aa  114  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  50.78 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  43.85 
 
 		 143 aa  110  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  40.15 
 
 		 147 aa  110  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  42.03 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  41.22 
 
 		 138 aa  107  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  39.1 
 
 		 142 aa  106  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  45.8 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  41.67 
 
 		 145 aa  102  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  43.8 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  36.15 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  41.13 
 
 		 137 aa  97.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  37.98 
 
 		 165 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  41.27 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  40.32 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  39.85 
 
 		 142 aa  94.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  44.83 
 
 		 131 aa  94.4  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  39.39 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  40.65 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  44.26 
 
 		 130 aa  92  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  40.46 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  37.98 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  40.35 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  38.21 
 
 		 131 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  44.63 
 
 		 152 aa  88.2  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  37.72 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  38.76 
 
 		 129 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  35.56 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  33.85 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  30.89 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  26.87 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  30.7 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  30.19 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2108  roadblock/LC7 family protein  30.19 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.854145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  28.57 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  26.85 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  31.4 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>