109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2067 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 142 aa  285  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  75.61 
 
 		 136 aa  195  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  74.38 
 
 		 140 aa  189  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  70.16 
 
 		 151 aa  186  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  70.49 
 
 		 135 aa  184  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  69.35 
 
 		 138 aa  181  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  64.84 
 
 		 146 aa  177  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  68.55 
 
 		 135 aa  177  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  63.2 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  60.77 
 
 		 136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  75.68 
 
 		 144 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  63.2 
 
 		 140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  63.11 
 
 		 139 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  58.02 
 
 		 139 aa  151  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  59.02 
 
 		 129 aa  151  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  54.92 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  58.27 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  54.26 
 
 		 149 aa  150  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  55.74 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  58.73 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  56.8 
 
 		 139 aa  144  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  52.21 
 
 		 151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  52.31 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  48.46 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  48.46 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  48.8 
 
 		 133 aa  127  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  48.78 
 
 		 133 aa  125  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  52.9 
 
 		 139 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  52.42 
 
 		 168 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  48.46 
 
 		 139 aa  124  5e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  50.41 
 
 		 142 aa  123  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  45.52 
 
 		 134 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  45.52 
 
 		 134 aa  121  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  46.83 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  50.72 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  45.45 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  48.39 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  47.2 
 
 		 150 aa  117  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  44.09 
 
 		 139 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  55.2 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  47.11 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  46.03 
 
 		 140 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  46.34 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  48.09 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  47.79 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  46.03 
 
 		 139 aa  113  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  46.09 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  42.52 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  48.39 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  43.28 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  42.62 
 
 		 140 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  44.8 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  48.44 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  40.71 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  41.48 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  44.07 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  41.32 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  44.7 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  43.18 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  42.4 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  43.08 
 
 		 135 aa  103  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  43.2 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  43.2 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  43.2 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  41.32 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  40.94 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  41.46 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  41.46 
 
 		 129 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  39.84 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  39.67 
 
 		 138 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  36.43 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  41.13 
 
 		 133 aa  90.5  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  39.2 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  41.8 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  43.61 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  41.67 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  37.82 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  39.84 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  37.4 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  34.71 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  35.77 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  35.71 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  34.68 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  34.17 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  34.92 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  34.38 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  34.65 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  34.96 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  32.52 
 
 		 137 aa  70.1  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  31.78 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  34.65 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  31.25 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  34.45 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  30.25 
 
 		 230 aa  53.9  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  29.6 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4122  Roadblock/LC7 family protein  27.19 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1692  roadblock/LC7 family protein  32.46 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0989  roadblock/LC7 family protein  32.46 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0658  roadblock/LC7 family protein  31.62 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>