98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5271 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 
139 aa  278  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  87.3 
 
 
134 aa  223  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  87.3 
 
 
134 aa  223  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  69.17 
 
 
135 aa  188  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  70.77 
 
 
135 aa  188  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  68.12 
 
 
139 aa  185  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  64.75 
 
 
139 aa  179  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  73.55 
 
 
150 aa  179  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  68.29 
 
 
140 aa  173  9e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  68.29 
 
 
142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  70.25 
 
 
151 aa  170  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  68.29 
 
 
140 aa  169  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  61.65 
 
 
140 aa  166  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  65.32 
 
 
133 aa  164  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  60.32 
 
 
138 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  62.81 
 
 
129 aa  161  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  60.32 
 
 
138 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  60.32 
 
 
138 aa  161  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  58.33 
 
 
147 aa  160  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  65.29 
 
 
140 aa  159  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  62.9 
 
 
133 aa  158  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  58.91 
 
 
140 aa  156  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  60.16 
 
 
135 aa  152  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  64.71 
 
 
140 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  61.16 
 
 
130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  58.4 
 
 
149 aa  150  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  58.59 
 
 
149 aa  150  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  58.27 
 
 
149 aa  149  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  60.83 
 
 
139 aa  147  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  57.85 
 
 
137 aa  146  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  62.6 
 
 
140 aa  144  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  56.45 
 
 
149 aa  140  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  56.67 
 
 
148 aa  137  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  54.2 
 
 
139 aa  136  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  49.19 
 
 
136 aa  130  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  52.89 
 
 
145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  49.22 
 
 
138 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  51.24 
 
 
134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  49.62 
 
 
143 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  55.28 
 
 
139 aa  121  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  50 
 
 
137 aa  121  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  54.47 
 
 
139 aa  120  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  49.17 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  54.92 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  48.2 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  52.8 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  50 
 
 
135 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  44.8 
 
 
131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  48.78 
 
 
140 aa  117  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  45.93 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  48.78 
 
 
138 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  50.82 
 
 
140 aa  115  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  51.64 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  48.46 
 
 
135 aa  114  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  46.03 
 
 
142 aa  113  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  40.58 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  50 
 
 
140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  50 
 
 
136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  45.31 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  47.93 
 
 
136 aa  110  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  47.58 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  42.86 
 
 
147 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  43.44 
 
 
143 aa  107  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  46.72 
 
 
139 aa  107  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  44.63 
 
 
142 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  45.67 
 
 
139 aa  103  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  46.72 
 
 
142 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  43.17 
 
 
141 aa  100  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  44.35 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  43.41 
 
 
139 aa  97.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  42.4 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  41.8 
 
 
143 aa  94.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  41.86 
 
 
168 aa  94.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  48.78 
 
 
136 aa  93.6  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  43.2 
 
 
134 aa  92  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  47.11 
 
 
130 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  45.38 
 
 
144 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  42.86 
 
 
137 aa  91.3  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  45.9 
 
 
150 aa  90.9  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  39.5 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  41.8 
 
 
141 aa  89.4  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  44.62 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  42.62 
 
 
133 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  50.45 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  39.47 
 
 
140 aa  82  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  35.71 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  36.51 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  38.21 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  32.5 
 
 
146 aa  73.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  38.35 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  37.93 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  31.5 
 
 
151 aa  70.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  33.86 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 
230 aa  54.7  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  27.83 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  30.85 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  28.43 
 
 
122 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  28.3 
 
 
115 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>