103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0975 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 140 aa  279  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  91.43 
 
 		 140 aa  260  4e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  82.61 
 
 		 139 aa  228  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  79.41 
 
 		 140 aa  226  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  73.19 
 
 		 142 aa  209  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  74.29 
 
 		 140 aa  209  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  76.56 
 
 		 133 aa  201  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  73.44 
 
 		 133 aa  197  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  71.21 
 
 		 135 aa  195  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  67.86 
 
 		 140 aa  194  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  67.14 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  70.97 
 
 		 139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  70.97 
 
 		 139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  69.84 
 
 		 151 aa  182  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  65.97 
 
 		 150 aa  176  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  65.32 
 
 		 147 aa  168  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  61.48 
 
 		 140 aa  167  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  63.71 
 
 		 134 aa  159  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  63.71 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  62.1 
 
 		 139 aa  156  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  52.94 
 
 		 138 aa  145  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  57.72 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  56.91 
 
 		 135 aa  140  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  57.02 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  49.26 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  47.48 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  47.79 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  53.72 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  44.6 
 
 		 149 aa  131  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  54.55 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  54.55 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  54.55 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  45.32 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  51.15 
 
 		 134 aa  130  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  52.27 
 
 		 139 aa  129  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  53.28 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  46.04 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  44.85 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  47.33 
 
 		 139 aa  124  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  49.21 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  50 
 
 		 139 aa  123  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  47.01 
 
 		 142 aa  122  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  44.78 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  44.7 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  45.04 
 
 		 135 aa  121  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  47.69 
 
 		 141 aa  120  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  44.8 
 
 		 135 aa  120  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  41.79 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  49.59 
 
 		 136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  47.66 
 
 		 140 aa  117  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  43.31 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  43.85 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  38.69 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  44.2 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  47.66 
 
 		 140 aa  114  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  47.54 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  44 
 
 		 151 aa  110  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  43.55 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  43.51 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  44.72 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  42.74 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  41.79 
 
 		 168 aa  103  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  41.41 
 
 		 149 aa  102  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  37.4 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  44.72 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  39.13 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  45.86 
 
 		 133 aa  100  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  43.08 
 
 		 141 aa  100  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  43.44 
 
 		 141 aa  100  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  46.15 
 
 		 136 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  40.87 
 
 		 140 aa  97.1  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  43.86 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  40 
 
 		 138 aa  95.5  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  40.74 
 
 		 165 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  41.73 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  35.48 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  40.58 
 
 		 139 aa  93.6  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  37.7 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  42.65 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  39.47 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  42.74 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  48.09 
 
 		 144 aa  90.1  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  42.4 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  37.12 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  40.5 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  39.2 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  41.53 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  30.43 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  34.35 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  37.3 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  35.83 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  37.3 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  30.89 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0335  roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  32.29 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2813  roadblock/LC7 family protein  27.56 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.581423  hitchhiker  0.00000177948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4464  roadblock/LC7 family protein  30.21 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1333  Roadblock/LC7 family protein  28.95 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3912  roadblock/LC7 family protein  30 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>