100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2825 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  270  6e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  83.33 
 
 		 138 aa  222  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  56.49 
 
 		 140 aa  150  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  56.49 
 
 		 140 aa  148  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  59.02 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  57.03 
 
 		 139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  53.44 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  57.85 
 
 		 133 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  56.56 
 
 		 139 aa  133  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  53.44 
 
 		 135 aa  130  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  54.92 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  52.89 
 
 		 140 aa  130  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  52.71 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  55.28 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  49.62 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  52.24 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  51.2 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  51.2 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  51.2 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  49.65 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  54.55 
 
 		 134 aa  127  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  54.55 
 
 		 134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  51.24 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  50.39 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  48.76 
 
 		 140 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  52.38 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  50.82 
 
 		 147 aa  120  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  52.07 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  51.15 
 
 		 140 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  46.77 
 
 		 135 aa  115  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  46.72 
 
 		 135 aa  115  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  45.31 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  45.31 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  46.72 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  45.31 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  43.75 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  50.78 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  47.33 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  50 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  45.45 
 
 		 139 aa  97.1  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  43.51 
 
 		 140 aa  97.1  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  40.77 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  44.27 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  39.34 
 
 		 141 aa  93.6  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  42.75 
 
 		 142 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  39.52 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  41.41 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  39.39 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  40.98 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  43.8 
 
 		 136 aa  90.9  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  39.34 
 
 		 135 aa  90.5  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  39.2 
 
 		 142 aa  90.1  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  41.28 
 
 		 149 aa  90.1  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  40.8 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  42.4 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  40.5 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  37.9 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  37.1 
 
 		 138 aa  87.4  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  37.19 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  40.48 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  36.8 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  39.68 
 
 		 168 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  39.67 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  42.11 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  41.41 
 
 		 145 aa  84  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  40.94 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  39.52 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  38.84 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  38.02 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  40.31 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  40.98 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  37.1 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  38.98 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  38.21 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  40.5 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  38.1 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  36.97 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  37.1 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  48.18 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  38.6 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  36.89 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  35.94 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  36.36 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  36.29 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  37.78 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  37.61 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  40 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  38.1 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  35.04 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  31.48 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  30.47 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  33.88 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  27.78 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  25.64 
 
 		 230 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  29.47 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2813  Roadblock/LC7 family protein  30.48 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1908  roadblock/LC7 family protein  28.04 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.129097  normal  0.495291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  30.85 
 
 		 122 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0033  roadblock/LC7 family protein  29.52 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0773  roadblock/LC7 family protein  29.52 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>