101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0311 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0311  Roadblock/LC7 family protein  100 
 
 		 148 aa  295  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3174  Roadblock/LC7 family protein  74.5 
 
 		 149 aa  223  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  0.235677 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0172  Roadblock/LC7 family protein  75 
 
 		 149 aa  217  3.9999999999999997e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.220534  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0273  Roadblock/LC7 family protein  72.66 
 
 		 149 aa  215  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.400039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01810  hypothetical protein  70.14 
 
 		 149 aa  214  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0643  hypothetical protein  56.12 
 
 		 140 aa  164  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5991  roadblock/LC7 family protein  56.12 
 
 		 140 aa  161  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173553  normal  0.0311318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7863  Roadblock/LC7 family protein  56.62 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.33246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0459  Roadblock/LC7 family protein  48.48 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5417  Roadblock/LC7 family protein  50.37 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1822  hypothetical protein  48.92 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.990156  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5271  Roadblock/LC7 family protein  56.67 
 
 		 139 aa  137  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0817  roadblock/LC7 family protein  57.5 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0761  roadblock/LC7 family protein  57.5 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635587  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34250  hypothetical protein  47.76 
 
 		 139 aa  133  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.669608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34280  hypothetical protein  48.12 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2113  hypothetical protein  46.9 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1789  hypothetical protein  48.18 
 
 		 140 aa  130  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0971  roadblock/LC7 family protein  48.89 
 
 		 139 aa  130  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.22997 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2859  hypothetical protein  52.31 
 
 		 139 aa  130  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.816259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4265  roadblock/LC7 family protein  56.3 
 
 		 135 aa  130  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2385  roadblock/LC7 family protein  52.31 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.519416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1804  Roadblock/LC7 family protein  48.46 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00227476  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1809  hypothetical protein  47.37 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3874  roadblock/LC7 family protein  55.46 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.215093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3227  roadblock/LC7 family protein  50 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24600  hypothetical protein  45.86 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1537  roadblock/LC7 family protein  49.19 
 
 		 129 aa  127  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1190  roadblock/LC7 domain-contain protein  46.21 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1207  roadblock/LC7 family protein  46.21 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1217  roadblock/LC7 family protein  46.21 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0700111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13400  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000448319  normal  0.0812473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0941  hypothetical protein  48.8 
 
 		 133 aa  123  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.247288  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0975  roadblock/LC7 family protein  47.48 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448438  normal  0.236015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5171  Roadblock/LC7 family protein  46.4 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1515  Roadblock/LC7 family protein  47.06 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.767548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3847  Roadblock/LC7 family protein  41.61 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.101468 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2277  roadblock/LC7 family protein  44.2 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0893919  normal  0.104236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3979  roadblock/LC7 family protein  49.11 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0155  roadblock/LC7 family protein  46.28 
 
 		 135 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0490  Roadblock/LC7 family protein  44.44 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0814  Roadblock/LC7 family protein  47.2 
 
 		 133 aa  115  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0586657 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3273  Roadblock/LC7 family protein  41.13 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1432  hypothetical protein  43.08 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645173  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4888  roadblock/LC7 family protein  48.28 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.629663  normal  0.016898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3598  roadblock/LC7 family protein  46.67 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.741712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0390  roadblock/LC7 family protein  48.09 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0303496  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1290  roadblock/LC7 family protein  48.03 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384978  hitchhiker  0.00358681 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5184  Roadblock/LC7 family protein  44.27 
 
 		 145 aa  110  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3338  Roadblock/LC7 family protein  47.06 
 
 		 133 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.643087  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3254  roadblock/LC7 family protein  44.09 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.238217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2825  hypothetical protein  43.75 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3804  Roadblock/LC7 family protein  45.67 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0357  hypothetical protein  46.9 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0225234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2067  Roadblock/LC7 family protein  44.07 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0361  hypothetical protein  43.8 
 
 		 135 aa  107  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3668  Roadblock/LC7 family protein  45.45 
 
 		 139 aa  107  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0812413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5471  roadblock/LC7 family protein  41.27 
 
 		 147 aa  103  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.886108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3382  Roadblock/LC7 family protein  40.58 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0893291  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37480  hypothetical protein  45.3 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3809  Roadblock/LC7 family protein  46.36 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2049  hypothetical protein  40.32 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2445  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.288681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2805  Roadblock/LC7 family protein  40.58 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000122057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0277  Roadblock/LC7 family protein  43.75 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0758  roadblock/LC7 family protein  45.76 
 
 		 136 aa  100  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02260  hypothetical protein  40.68 
 
 		 136 aa  99  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.591934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3194  hypothetical protein  44.07 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2201  Roadblock/LC7 family protein  48.28 
 
 		 152 aa  96.7  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.590655  hitchhiker  0.000219247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2446  Roadblock/LC7 family protein  36.36 
 
 		 165 aa  96.3  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5598  Roadblock/LC7 family protein  40.68 
 
 		 131 aa  94  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4131  Roadblock/LC7 family protein  39.17 
 
 		 136 aa  93.2  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2845  Roadblock/LC7 family protein  43.24 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12388  normal  0.326627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3691  Roadblock/LC7 family protein  40.52 
 
 		 131 aa  91.3  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0125896  normal  0.658373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5488  roadblock/LC7 family protein  38.33 
 
 		 168 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0729235  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3315  Roadblock/LC7 family protein  41.67 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0700  roadblock/LC7 family protein  44.92 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4815  Roadblock/LC7 family protein  39.34 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966307  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06950  hypothetical protein  37.3 
 
 		 138 aa  85.5  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336684  normal  0.0389963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1146  Roadblock/LC7 family protein  40.32 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3125  hypothetical protein  40.8 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.370766 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2806  hypothetical protein  34.75 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0542054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1139  Roadblock/LC7 family protein  38.14 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385251  normal  0.882845 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2754  Roadblock/LC7 family protein  38.84 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.183617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33560  hypothetical protein  38.1 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0896592  normal  0.486704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4331  hypothetical protein  35.94 
 
 		 129 aa  76.6  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2533  Roadblock/LC7 family protein  36.36 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3053  Roadblock/LC7 family protein  42.45 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4181  Roadblock/LC7 family protein  36.22 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534028  normal  0.367859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0738  Roadblock/LC7 family protein  33.33 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1061  Roadblock/LC7 family protein  37.5 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0364  Roadblock/LC7 family protein  29.75 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1436  Roadblock/LC7 family protein  29.69 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.594453  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1325  roadblock/LC7 family protein  32.79 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.0893662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0274  Roadblock/LC7 family protein  27.97 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2399  Roadblock/LC7 family protein  31.93 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.315858  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5249  Roadblock/LC7 family protein  30.25 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955788  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0746  roadblock/LC7 family protein  30.53 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000852745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3625  Roadblock/LC7 family protein  26.79 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1006  roadblock/LC7 family protein  28.97 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.428336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>